RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060956.12

Trappc1-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc1, Length 628 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1-201ENSMUST00000060956 FosP01101 380 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adh5P28474 374 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mmp3P28862 477 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 InaP46660 501 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gp1bbP56400 206 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dlg3P70175 849 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nfe2Q07279 373 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Agbl5Q09M02 886 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cnnm2Q3TWN3 875 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Foxred2Q3USW5 665 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm428Q3UTE2 360 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Itpripl2Q3UV16 535 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Grhl3Q5FWH3 603 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cd6Q61003 665 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc44a1Q6X893 653 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Casd1Q7TN73 797 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nol12Q8BG17 217 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cstf2Q8BIQ5 580 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Fbxo44Q8BK26 255 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr61Q8C010 449 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp44Q8C2S0 711 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Frat2Q8K025 231 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Appl2Q8K3G9 662 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bbox1Q924Y0 387 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Anapc16Q9CPV2 110 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CabyrQ9D424 453 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Cul5Q9D5V5 780 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 TsaccQ9DA44 124 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pla2g12aQ9EPR2 192 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GabrqQ9JLF1 638 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Git2Q9JLQ2 708 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MthfrQ9WU20 654 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Psmd10Q9Z2X2 231 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zzef1Q5SSH7 2924 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Sptbn4E9PX29 2561 aa5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gbf1Q6DFZ1 1861 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Taf1Q80UV9 1891 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Igkv17-121A0A0G2JFA8 117 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pramel3A2AHA7 463 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm7903A2AWL1 463 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc16a6B1AT66 607 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Adamtsl5D3Z689 485 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm38392E9Q2A2 434 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zfp882E9Q4R4 555 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Srsf5O35326 269 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 UgcgO88693 394 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 CcnoP0C242 352 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AladP10518 330 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 MecomP14404 1042 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 AmhP27106 555 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Mtx1P47802 317 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Anapc15P60007 132 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Irf7P70434 457 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Bach2P97303 839 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nrp1P97333 923 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Nucb1Q02819 459 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 March5Q3KNM2 278 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pgap2Q3TQR0 254 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pank2Q3U4S0 443 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Slc39a10Q6P5F6 833 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif18bQ6PFD6 834 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tmem132dQ76HP3 1097 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GypcQ78HU7 95 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Otop2Q80SX5 563 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ostm1Q8BGT0 338 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Hps6Q8BLY7 805 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ubac1Q8VDI7 409 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gdpd3Q99LY2 330 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Krt84Q99M73 603 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Lamtor5Q9D1L9 91 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rab13Q9DD03 202 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Rbp7Q9EPC5 134 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 WtapQ9ER69 396 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Trhr2Q9ERT2 382 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ush1cQ9ES64 910 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 GdaQ9R111 454 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Akt3Q9WUA6 479 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 ReckQ9Z0J1 971 aa5.98□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gm9573F7C950 1606 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Ms4a12A0A087WSB9 263 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 R3hdmlA2A5I3 253 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Zkscan2G3X952 960 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Vmn2r111K7N674 857 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 P01878 344 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 PrnpP04925 254 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Pim1P06803 397 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Npr1P18293 1057 aa5.97□□□□□ -1.45
Trappc1-201ENSMUST00000060956 Gpr3P35413 330 aa5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.5 ms