Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
Gbf1Q6DFZ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Gbf1Q6DFZ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Gbf1Q6DFZ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Gbf1Q6DFZ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Gbf1Q6DFZ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Gbf1Q6DFZ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Gbf1Q6DFZ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Gbf1Q6DFZ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Gbf1Q6DFZ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Gbf1Q6DFZ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gbf1Q6DFZ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gbf1Q6DFZ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Gbf1Q6DFZ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gbf1Q6DFZ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Gbf1Q6DFZ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Gbf1Q6DFZ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Gbf1Q6DFZ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Gbf1Q6DFZ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gbf1Q6DFZ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Gbf1Q6DFZ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gbf1Q6DFZ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gbf1Q6DFZ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gbf1Q6DFZ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gbf1Q6DFZ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gbf1Q6DFZ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Gbf1Q6DFZ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gbf1Q6DFZ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Gbf1Q6DFZ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Gbf1Q6DFZ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Gbf1Q6DFZ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gbf1Q6DFZ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Gbf1Q6DFZ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Gbf1Q6DFZ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gbf1Q6DFZ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gbf1Q6DFZ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Gbf1Q6DFZ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gbf1Q6DFZ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gbf1Q6DFZ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Gbf1Q6DFZ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gbf1Q6DFZ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gbf1Q6DFZ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Gbf1Q6DFZ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Gbf1Q6DFZ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gbf1Q6DFZ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gbf1Q6DFZ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gbf1Q6DFZ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gbf1Q6DFZ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Gbf1Q6DFZ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Gbf1Q6DFZ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gbf1Q6DFZ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Gbf1Q6DFZ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Gbf1Q6DFZ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gbf1Q6DFZ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gbf1Q6DFZ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Gbf1Q6DFZ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Gbf1Q6DFZ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gbf1Q6DFZ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gbf1Q6DFZ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Gbf1Q6DFZ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gbf1Q6DFZ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gbf1Q6DFZ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gbf1Q6DFZ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Gbf1Q6DFZ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gbf1Q6DFZ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Gbf1Q6DFZ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gbf1Q6DFZ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Gbf1Q6DFZ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gbf1Q6DFZ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gbf1Q6DFZ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Gbf1Q6DFZ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gbf1Q6DFZ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gbf1Q6DFZ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gbf1Q6DFZ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gbf1Q6DFZ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gbf1Q6DFZ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gbf1Q6DFZ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Gbf1Q6DFZ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Gbf1Q6DFZ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Gbf1Q6DFZ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Gbf1Q6DFZ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Gbf1Q6DFZ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Gbf1Q6DFZ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Gbf1Q6DFZ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Gbf1Q6DFZ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gbf1Q6DFZ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gbf1Q6DFZ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gbf1Q6DFZ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gbf1Q6DFZ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gbf1Q6DFZ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gbf1Q6DFZ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gbf1Q6DFZ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gbf1Q6DFZ1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gbf1Q6DFZ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
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