Protein–RNA interactions for Protein: P28474

Adh5, Alcohol dehydrogenase class-3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adh5P28474 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Adh5P28474 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Adh5P28474 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Adh5P28474 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Adh5P28474 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Adh5P28474 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Adh5P28474 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Adh5P28474 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Adh5P28474 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Adh5P28474 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Adh5P28474 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Adh5P28474 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Adh5P28474 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Adh5P28474 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Adh5P28474 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Adh5P28474 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Adh5P28474 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Adh5P28474 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Adh5P28474 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Adh5P28474 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Adh5P28474 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Adh5P28474 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Adh5P28474 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Adh5P28474 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Adh5P28474 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Adh5P28474 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Adh5P28474 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Adh5P28474 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Adh5P28474 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Adh5P28474 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Adh5P28474 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Adh5P28474 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Adh5P28474 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Adh5P28474 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Adh5P28474 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Adh5P28474 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Adh5P28474 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Adh5P28474 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Adh5P28474 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Adh5P28474 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Adh5P28474 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Adh5P28474 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Adh5P28474 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Adh5P28474 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Adh5P28474 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Adh5P28474 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Adh5P28474 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Adh5P28474 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Adh5P28474 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Adh5P28474 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Adh5P28474 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Adh5P28474 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Adh5P28474 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Adh5P28474 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Adh5P28474 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Adh5P28474 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Adh5P28474 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Adh5P28474 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Adh5P28474 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Adh5P28474 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Adh5P28474 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Adh5P28474 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Adh5P28474 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Adh5P28474 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Adh5P28474 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Adh5P28474 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Adh5P28474 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Adh5P28474 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Adh5P28474 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Adh5P28474 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Adh5P28474 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Adh5P28474 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Adh5P28474 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Adh5P28474 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Adh5P28474 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Adh5P28474 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Adh5P28474 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Adh5P28474 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Adh5P28474 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Adh5P28474 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Adh5P28474 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Adh5P28474 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Adh5P28474 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Adh5P28474 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Adh5P28474 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Adh5P28474 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Adh5P28474 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Adh5P28474 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Adh5P28474 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Adh5P28474 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Adh5P28474 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Adh5P28474 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Adh5P28474 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Adh5P28474 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Adh5P28474 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Adh5P28474 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Adh5P28474 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Adh5P28474 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Adh5P28474 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Adh5P28474 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms