Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
Nrp1P97333 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Nrp1P97333 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Nrp1P97333 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Nrp1P97333 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Nrp1P97333 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nrp1P97333 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Nrp1P97333 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Nrp1P97333 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Nrp1P97333 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Nrp1P97333 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Nrp1P97333 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Nrp1P97333 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Nrp1P97333 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nrp1P97333 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Nrp1P97333 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Nrp1P97333 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Nrp1P97333 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Nrp1P97333 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Nrp1P97333 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Nrp1P97333 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Nrp1P97333 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Nrp1P97333 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Nrp1P97333 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Nrp1P97333 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Nrp1P97333 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Nrp1P97333 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Nrp1P97333 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Nrp1P97333 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nrp1P97333 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Nrp1P97333 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Nrp1P97333 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nrp1P97333 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Nrp1P97333 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Nrp1P97333 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Nrp1P97333 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Nrp1P97333 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Nrp1P97333 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nrp1P97333 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nrp1P97333 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nrp1P97333 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nrp1P97333 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nrp1P97333 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nrp1P97333 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nrp1P97333 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nrp1P97333 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nrp1P97333 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nrp1P97333 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nrp1P97333 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Nrp1P97333 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nrp1P97333 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nrp1P97333 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nrp1P97333 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nrp1P97333 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Nrp1P97333 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nrp1P97333 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nrp1P97333 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nrp1P97333 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Nrp1P97333 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Nrp1P97333 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Nrp1P97333 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Nrp1P97333 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Nrp1P97333 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Nrp1P97333 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Nrp1P97333 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Nrp1P97333 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Nrp1P97333 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Nrp1P97333 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nrp1P97333 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nrp1P97333 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nrp1P97333 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Nrp1P97333 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Nrp1P97333 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Nrp1P97333 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nrp1P97333 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nrp1P97333 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nrp1P97333 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nrp1P97333 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nrp1P97333 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nrp1P97333 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nrp1P97333 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nrp1P97333 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nrp1P97333 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Nrp1P97333 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nrp1P97333 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nrp1P97333 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nrp1P97333 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nrp1P97333 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nrp1P97333 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Nrp1P97333 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nrp1P97333 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nrp1P97333 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nrp1P97333 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nrp1P97333 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nrp1P97333 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms