Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.88■■■■■ 4.45
FosP01101 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
FosP01101 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
FosP01101 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
FosP01101 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
FosP01101 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FosP01101 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
FosP01101 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
FosP01101 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
FosP01101 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FosP01101 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FosP01101 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FosP01101 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FosP01101 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
FosP01101 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FosP01101 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
FosP01101 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
FosP01101 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
FosP01101 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
FosP01101 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
FosP01101 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
FosP01101 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
FosP01101 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FosP01101 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FosP01101 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FosP01101 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FosP01101 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
FosP01101 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
FosP01101 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
FosP01101 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FosP01101 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FosP01101 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FosP01101 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FosP01101 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FosP01101 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
FosP01101 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FosP01101 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FosP01101 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FosP01101 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FosP01101 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FosP01101 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FosP01101 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
FosP01101 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FosP01101 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
FosP01101 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FosP01101 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FosP01101 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FosP01101 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FosP01101 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FosP01101 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
FosP01101 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
FosP01101 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
FosP01101 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FosP01101 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FosP01101 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
FosP01101 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
FosP01101 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FosP01101 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FosP01101 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
FosP01101 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
FosP01101 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
FosP01101 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FosP01101 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
FosP01101 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FosP01101 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FosP01101 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FosP01101 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FosP01101 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FosP01101 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FosP01101 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FosP01101 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FosP01101 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FosP01101 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FosP01101 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
FosP01101 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
FosP01101 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FosP01101 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FosP01101 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FosP01101 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
FosP01101 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
FosP01101 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
FosP01101 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
FosP01101 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FosP01101 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FosP01101 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FosP01101 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FosP01101 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FosP01101 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
FosP01101 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
FosP01101 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FosP01101 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
FosP01101 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FosP01101 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FosP01101 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
FosP01101 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FosP01101 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
FosP01101 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FosP01101 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
FosP01101 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
FosP01101 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms