RNA–Protein interactions for RNA: YKR019C

IRS4, Transcript of EH domain-containing protein, yeast

Gene IRS4, Length 1,848 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IRS4	YKR019C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	TVP18	Q04767	167 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YLR177W	Q06251	628 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MCA1	Q08601	432 aa		5.09	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YHR139C-A	O13536	103 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	BI2	P03873	423 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	TIR1	P10863	254 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SKG1	P36169	355 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MBA1	P38300	278 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RRT5	P43607	289 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	NRM1	P53718	249 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YNR062C	P53748	327 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	GOT1	Q03554	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	NAT3	Q06504	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SPC3	Q12133	184 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	EAF3	Q12432	401 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	BCK1	Q01389	1478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	NSE4	P43124	402 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ERV29	P53337	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YLR042C	Q07990	161 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	NUP192	P47054	1683 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	HEM14	P40012	539 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YGL230C	P53074	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YNL033W	P53964	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YNL019C	P53975	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RNH202	Q05635	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
IRS4	YKR019C	YPS3	Q12303	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	KTI11	Q3E840	82 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		5.07	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	GPX1	P36014	167 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YBR063C	P38083	404 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YEL075C	P39972	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YER189W	P40104	122 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	FIP1	P45976	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RSF2	P46974	1380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	REP2	P03872	296 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	Q0255	P03881	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ERG4	P25340	473 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ATS1	P31386	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SRP21	P32342	167 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	OMA1	P36163	345 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	MIT1	P40002	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YIL024C	P40543	189 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	GTT1	P40582	234 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YGL088W	P53151	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ELC1	Q03071	99 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	DGK1	Q12382	290 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	PCL9	Q12477	304 aa		5.05	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ETR1	P38071	380 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YBR090C	P38253	122 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YHR140W	P38842	239 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	GPI2	P46961	280 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	TTI2	P47168	421 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SBH1	P52870	82 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	TPC1	P53257	314 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	HUT1	Q12520	339 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	HEM4	P06174	275 aa		5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	DOP1	Q03921	1698 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RPL14A	P36105	138 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	RPL14B	P38754	138 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	YER181C	P40097	107 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	GON7	P46984	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	FMP48	P53233	369 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	AAH1	P53909	347 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	COA4	Q05809	96 aa		5.03	□□□□□ -1.6
IRS4	YKR019C	AGA1	P32323	725 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YMC2	P38087	329 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RPB11	P38902	120 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	RCN1	P36054	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	CAT5	P41735	233 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YNR014W	P53719	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	YMR181C	Q03231	154 aa		5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
IRS4	YKR019C	MIM1	Q08176	113 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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