RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C TSA2Q04120 196 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C GRH1Q04410 372 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SOG2Q08817 791 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C RKI1Q12189 258 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C MED4Q12343 284 aa5.41□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C FMT1P32785 401 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HTD2P38790 280 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C MPC2P38857 129 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C YJR012CP47087 207 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C UBP8P50102 471 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C LRS4Q04087 347 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C VBA1Q04301 562 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SCW10Q04951 389 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C HUG1Q6Q5K6 68 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C SUS1Q6WNK7 96 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C UBA3Q99344 299 aa5.4□□□□□ -1.54
SPE3YPR069C TY1A-DR4O74302 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-AP0CX57 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-PR1P0CX58 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-ORP0CX59 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-PR2P0CX60 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-DR5P0CX65 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-ER2P0CX66 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-GR3P0CX67 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-LR1P0CX68 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-MR2P0CX69 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MIR1P23641 311 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C GPX2P38143 162 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-JR2P47099 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C NUP42P49686 430 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C IMD3P50095 523 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CRH1P53301 507 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-DR1Q03856 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YFH1Q07540 174 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YNG1Q08465 219 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-BRQ12217 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-NL2Q12470 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-GR2Q12485 440 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C HBN1Q96VH4 193 aa5.39□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CDC23P16522 626 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C DIT1P21623 536 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MRS4P23500 304 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TRR1P29509 319 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C VMA8P32610 256 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MIC12P38341 106 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C GET2P40056 285 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CAT5P41735 233 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C ERV29P53337 310 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YDR274CP87283 123 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YML018CQ03730 393 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MSC3Q05812 728 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MSH5Q12175 901 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C PET20Q99373 253 aa5.38□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C PDC2P32896 925 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MBA1P38300 278 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CPR8P53728 308 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MEH1Q02205 184 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YLR031WQ07978 186 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YDR215CQ12240 137 aa5.37□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C NOP1P15646 327 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CPR4P25334 318 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YPS1P32329 569 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C ATP3P38077 311 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C IES5P40060 125 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C AIM20P40451 204 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TDA6Q06466 467 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C SYM1Q06563 197 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YOL029CQ08187 201 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YJR112W-AQ3E743 109 aa5.36□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C LST8P41318 303 aa5.35□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C GIM3P53900 129 aa5.35□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YOR385WQ08909 290 aa5.35□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C RAD28Q12021 506 aa5.35□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C SOD1P00445 154 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C JLP2P40206 208 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YGR210CP42942 411 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C LSM1P47017 172 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C CPD1P53314 239 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C SPO19Q03029 223 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C NRG1Q03125 231 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C YMR181CQ03231 154 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C TY1A-MR1Q04215 440 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C MGR3Q04472 501 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C IRC23Q08416 157 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C SCP1Q08873 200 aa5.34□□□□□ -1.55
SPE3YPR069C PET494P07390 489 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C RNP1P32385 249 aa5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ALK2P32789 676 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C ECM33P38248 429 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YPT31P38555 223 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
SPE3YPR069C YHR122WP38829 231 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.8 ms