RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322090.7

NIPSNAP2-201, Transcript of nipsnap homolog 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP2, Length 1,999 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF606Q8WXB4 792 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NUP85Q9BW27 656 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FKTNO75072 461 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ITGB3P05106 788 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 WEE2P0C1S8 567 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CD58P19256 250 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NKX3-2P78367 333 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GNASQ5JWF2 1037 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CPA5Q8WXQ8 436 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 BCO2Q9BYV7 579 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SEPT4O43236 478 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 THAP12O43422 761 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NPTXRO95502 500 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ELNP15502 786 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 AXLP30530 894 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ATICP31939 592 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NSFP46459 744 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 VSNL1P62760 191 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NOMO3P69849 1222 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SNX17Q15036 470 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NAA35Q5VZE5 725 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RRP9O43818 475 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MYBL1P10243 752 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 USP38Q8NB14 1042 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIM11Q96F44 468 aa24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C1QTNF8P60827 252 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MON1BQ7L1V2 547 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TMEM59LQ9UK28 342 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 POLIQ9UNA4 740 aa24.21■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GNRH1P01148 92 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TAF2Q6P1X5 1199 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SNTG2Q9NY99 539 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CITO14578 2027 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CEP104O60308 925 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PGK1P00558 417 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SPC25Q9HBM1 224 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DERAQ9Y315 318 aa24.2■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RARBP10826 455 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF394Q53GI3 561 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PASD1Q8IV76 773 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.465e-7■■■□□ 18.9
NIPSNAP2-201ENST00000322090 LRRC1Q9BTT6 524 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CARD9Q9H257 536 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DPP3Q9NY33 737 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DNAH12Q6ZR08 3092 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RRM1P23921 792 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MESDQ14696 234 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KIF12Q96FN5 646 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SNX27Q96L92 541 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ADAMTS4O75173 837 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 COMTP21964 271 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MCM3P25205 808 aa24.18■■□□□ 1.46
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GUCY2FP51841 1108 aa24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms