RNA–Protein interactions for RNA: YOR346W

REV1, Transcript of Deoxycytidyl transferase, yeast

Gene REV1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REV1	YOR346W	SUM1	P46676	1062 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	YNL165W	P53891	406 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	UBP2	Q01476	1272 aa		4.17	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	JJJ2	P46997	583 aa		4.15	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	ROM1	P53046	1155 aa		4.15	□□□□□ -1.74
REV1	YOR346W	ATG3	P40344	310 aa		4.15	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	HPF1	Q05164	967 aa		4.15	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	YLR346C	Q06139	101 aa		4.15	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	TSC13	Q99190	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	PUP1	P25043	261 aa		4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	TGL4	P36165	910 aa		4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	CPS1	P27614	576 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	PSH1	Q12161	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	SUV3	P32580	737 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	NTH2	P35172	780 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	KTR7	P40504	517 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	ALD2	P47771	506 aa		4.13	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	UBP1	P25037	809 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	PHO87	P25360	923 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	CUZ1	P53899	274 aa		4.12	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	GAL2	P13181	574 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	UBP15	P50101	1230 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	YML083C	Q04526	418 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	MCM1	P11746	286 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	HXT5	P38695	592 aa		4.11	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	IRE1	P32361	1115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	SIS2	P36024	562 aa		4.1	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	TBS1	P38114	1094 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	JJJ3	P47138	172 aa		4.09	□□□□□ -1.75
REV1	YOR346W	MLF3	P32047	452 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	ECM23	Q02710	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	CYT1	P07143	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	GAS4	Q08271	471 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
REV1	YOR346W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	CAB1	Q04430	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	HAP4	P14064	554 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	DIT1	P21623	536 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	KTR2	P33550	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	MSC7	P38694	644 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.07	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	SPR3	P41901	512 aa		4.06	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	TRK2	P28584	889 aa		4.06	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	YGR035C	P53222	116 aa		4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
REV1	YOR346W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	YFL066C	P43538	392 aa		4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.05	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	UBX7	P38349	436 aa		4.04	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	LYS5	P50113	272 aa		4.04	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	RPC31	P17890	251 aa		4.03	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	DPH6	Q12429	685 aa		4.03	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	MRPL16	P38064	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	RLF2	Q12495	606 aa		4.03	□□□□□ -1.76
REV1	YOR346W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	RGP1	P16664	663 aa		4.02	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	SKP1	P52286	194 aa		4.02	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	YBR197C	P38306	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	STB3	Q12427	513 aa		4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	MDJ1	P35191	511 aa		4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	CEM1	P39525	442 aa		4	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	SCD5	P34758	872 aa		4	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	YNR040W	P53736	256 aa		3.99	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	MRPL33	P20084	86 aa		3.99	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	VAN1	P23642	535 aa		3.99	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	QDR2	P40474	542 aa		3.98	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	VMA3	P25515	160 aa		3.97	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	BOL3	P39724	118 aa		3.97	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	MRP10	O75012	95 aa		3.97	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	ITC1	P53125	1264 aa		3.97	□□□□□ -1.77
REV1	YOR346W	APC11	Q12157	165 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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