RNA–Protein interactions for RNA: YHR141C

RPL42B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L42B, yeast

Gene RPL42B, Length 321 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL42B	YHR141C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.22	□□□□□ -1.89	not detected
RPL42B	YHR141C	SRF1	Q12516	437 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RPL42B	YHR141C	CCP1	P00431	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	YGR035C	P53222	116 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	DFG5	Q05031	458 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	HPF1	Q05164	967 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	YPQ2	Q06328	317 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	MCM1	P11746	286 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	UTR2	P32623	467 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	KTR7	P40504	517 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	VTC4	P47075	721 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	ECM23	Q02710	187 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	BDS1	Q08347	646 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	WTM2	Q12206	467 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SWI5	P08153	709 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	ROG3	P43602	733 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	UBP2	Q01476	1272 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	TCB1	Q12466	1186 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	CYT1	P07143	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SUV3	P32580	737 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	NTH2	P35172	780 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	UBX7	P38349	436 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	OSH7	P38755	437 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SUM1	P46676	1062 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	MTC5	Q03897	1148 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	NOP8	Q08287	484 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	DPH6	Q12429	685 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SRS2	P12954	1174 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	VAN1	P23642	535 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	DLD1	P32891	587 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	TBS1	P38114	1094 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SSN3	P39073	555 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	MSN5	P52918	1224 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	TRS33	Q99394	268 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	DAL1	P32375	460 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	SLA1	P32790	1244 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	JJJ3	P47138	172 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
RPL42B	YHR141C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	HXT5	P38695	592 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	LYS5	P50113	272 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	LSO1	Q3E827	93 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	CAB1	Q04430	367 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	PNP1	Q05788	311 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	APC11	Q12157	165 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	SCD5	P34758	872 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	YBR197C	P38306	217 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	BOL3	P39724	118 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ICP55	P40051	511 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	JJJ2	P46997	583 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	CWH41	P53008	833 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ATG1	P53104	897 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	YNL165W	P53891	406 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	YML020W	Q03722	664 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	PUN1	Q06991	263 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	PHM7	Q12252	991 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	MRPL33	P20084	86 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	KTR2	P33550	425 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ERP5	P38819	212 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	YFL066C	P43538	392 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ACF4	P47129	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	IRE1	P32361	1115 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ISC10	P32645	267 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	RRN6	P32786	894 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	MDJ2	P42834	146 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	ALD2	P47771	506 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	UBP15	P50101	1230 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	CUZ1	P53899	274 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	PSH1	Q12161	406 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	HAT1	Q12341	374 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	RPC31	P17890	251 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	MLF3	P32047	452 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	SKP1	P52286	194 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RPL42B	YHR141C	KAR5	Q04746	504 aa		3.09	□□□□□ -1.91

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