RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNA6P17658 529 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRVP-204ENST00000639439 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRVP-204ENST00000639439 CLTCL1P53675 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
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PTPRVP-204ENST00000639439 KIF1BO60333 1816 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRVP-204ENST00000639439 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRVP-204ENST00000639439 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTPRVP-204ENST00000639439 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRVP-204ENST00000639439 ATF3P18847 181 aa23.18■■□□□ 1.3
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PTPRVP-204ENST00000639439 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.05■■□□□ 1.28
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PTPRVP-204ENST00000639439 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.85■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 POTEAQ6S8J7 498 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 LRP6O75581 1613 aa22.83■■□□□ 1.25
PTPRVP-204ENST00000639439 SIRT1Q96EB6 747 aa22.83■■□□□ 1.25
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