RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623687.1

DUX4L28-201, Transcript of double homeobox 4 like 28, humanhuman

BASIC

Gene DUX4L28, Length 678 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L28-201ENST00000623687 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.26■■■■■ 4.04
DUX4L28-201ENST00000623687 ALKQ9UM73 1620 aa40.26■■■■■ 4.04
DUX4L28-201ENST00000623687 TRIM52Q96A61 297 aa40.25■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 CLTCL1P53675 1640 aa40.24■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 TRPM2O94759 1503 aa40.24■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.23■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 NWD1Q149M9 1564 aa40.2■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 BCANQ96GW7 911 aa40.2■■■■■ 4.03
DUX4L28-201ENST00000623687 TOM1O60784 492 aa40.19■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.18■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 KCNA6P17658 529 aa40.16■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 PIP4K2BP78356 416 aa40.14■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
DUX4L28-201ENST00000623687 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 KIF1BO60333 1816 aa40.13■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.1■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 DIP2AQ14689 1571 aa40.08■■■■■ 4.01
DUX4L28-201ENST00000623687 TMEM94Q12767 1356 aa40.06■■■■■ 4
DUX4L28-201ENST00000623687 TBX22Q9Y458 520 aa40.05■■■■■ 4
DUX4L28-201ENST00000623687 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.04■■■■■ 4
DUX4L28-201ENST00000623687 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.03■■■■■ 4
DUX4L28-201ENST00000623687 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
DUX4L28-201ENST00000623687 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa39.98■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 FOXD1Q16676 465 aa39.98■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.98■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 HSPA1LP34931 641 aa39.97■■■■□ 3.99
DUX4L28-201ENST00000623687 PIK3R4Q99570 1358 aa39.93■■■■□ 3.98
DUX4L28-201ENST00000623687 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.92■■■■□ 3.98
DUX4L28-201ENST00000623687 PTPRUQ92729 1446 aa39.88■■■■□ 3.97
DUX4L28-201ENST00000623687 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.84■■■■□ 3.97
DUX4L28-201ENST00000623687 PPLO60437 1756 aa39.84■■■■□ 3.97
DUX4L28-201ENST00000623687 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
DUX4L28-201ENST00000623687 MSH6P52701 1360 aa39.81■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.81■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 CCDC144AA2RUR9 1427 aa39.8■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa39.79■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 METP08581 1390 aa39.78■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa39.76■■■■□ 3.96
DUX4L28-201ENST00000623687 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.75■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.75■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa39.75■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.73■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 VGFO15240 615 aaPredicted RBP39.72■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 IFT172Q9UG01 1749 aa39.71■■■■□ 3.95
DUX4L28-201ENST00000623687 C14orf37Q86TY3 774 aa39.66■■■■□ 3.94
DUX4L28-201ENST00000623687 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
DUX4L28-201ENST00000623687 RGL3Q3MIN7 710 aa39.62■■■■□ 3.93
DUX4L28-201ENST00000623687 SLAIN2Q9P270 581 aa39.62■■■■□ 3.93
DUX4L28-201ENST00000623687 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.6■■■■□ 3.93
DUX4L28-201ENST00000623687 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa39.56■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.54■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.53■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.53■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 ATF3P18847 181 aa39.52■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 HRCP23327 699 aa39.52■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 ILDR2Q71H61 639 aa39.52■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 DCCP43146 1447 aa39.51■■■■□ 3.92
DUX4L28-201ENST00000623687 PHLPP1O60346 1717 aa39.51■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 PTCH1Q13635 1447 aa39.5■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.49■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.48■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.46■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 PIK3C2GO75747 1445 aa39.45■■■■□ 3.91
DUX4L28-201ENST00000623687 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.43■■■■□ 3.9
DUX4L28-201ENST00000623687 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.41■■■■□ 3.9
DUX4L28-201ENST00000623687 MST1RQ04912 1400 aa39.4■■■■□ 3.9
DUX4L28-201ENST00000623687 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
DUX4L28-201ENST00000623687 MYOM2P54296 1465 aa39.37■■■■□ 3.89
DUX4L28-201ENST00000623687 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.37■■■■□ 3.89
DUX4L28-201ENST00000623687 BRINP3Q76B58 766 aa39.33■■■■□ 3.89
DUX4L28-201ENST00000623687 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.33■■■■□ 3.89
DUX4L28-201ENST00000623687 TECPR2O15040 1411 aa39.31■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 LAMC1P11047 1609 aa39.29■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.29■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.27■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 STK26Q9P289 416 aa39.26■■■■□ 3.88
DUX4L28-201ENST00000623687 JCADQ9P266 1359 aa39.25■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 ABCC11Q96J66 1382 aa39.23■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.22■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.2■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa39.2■■■■□ 3.87
DUX4L28-201ENST00000623687 SHPRHQ149N8 1683 aa39.19■■■■□ 3.86
DUX4L28-201ENST00000623687 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.17■■■■□ 3.86
DUX4L28-201ENST00000623687 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.17■■■■□ 3.86
DUX4L28-201ENST00000623687 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
DUX4L28-201ENST00000623687 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.12■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms