RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CDCA7LQ96GN5 454 aa3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RCCD1A6NED2 376 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 POM121CA8CG34 1229 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NDUFV2P19404 249 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RBM25P49756 843 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 IRF5Q13568 498 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RSPH4AQ5TD94 716 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP2R2DQ66LE6 453 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZNF710Q8N1W2 664 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC39A7Q92504 469 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MTMR7Q9Y216 660 aa3.02□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPTLC1O15269 473 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NUDT7P0C024 238 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C7P10643 843 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CD46P15529 392 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOSBP53539 338 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 QPCTQ16769 361 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NUDT18Q6ZVK8 323 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PBXIP1Q96AQ6 731 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ADAM33Q9BZ11 813 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PNMA3Q9UL41 463 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa3.01□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NBPF26B4DH59 902 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RIMBP2O15034 1052 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USP17L8P0C7I0 530 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAJB2P25686 324 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EVX2Q03828 476 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WASHC4Q2M389 1173 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CABLES1Q8TDN4 633 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZBTB3Q9H5J0 574 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 METRNQ9UJH8 293 aa3□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LILRB3O75022 631 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KDM4AO75164 1064 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GABBR2O75899 941 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PTPREP23469 700 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SLC4A3P48751 1232 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HDGFP51858 240 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 VAC14Q08AM6 782 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TUSC1Q2TAM9 212 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CDCA8Q53HL2 280 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ARSIQ5FYB1 569 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PACS2Q86VP3 889 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TTC13Q8NBP0 860 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RGS22Q8NE09 1264 aa2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 E9PSI1 815 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C6orf229H3BNL8 230 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMAPO00193 183 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 BRD1O95696 1058 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FDX1P10109 184 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CTDSPL2Q05D32 466 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KCNA1Q09470 495 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SEMA3FQ13275 785 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DOK7Q18PE1 504 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PNMA1Q8ND90 353 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TATDN2Q93075 761 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KCNH8Q96L42 1107 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EYA1Q99502 592 aa2.98□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CARNS1A5YM72 827 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SOCS7O14512 581 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COL9A1P20849 921 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GJA5P36382 358 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USP46P62068 366 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MTMR2Q13614 643 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CCDC27Q2M243 656 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GRIPAP1Q4V328 841 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TMEM134Q9H6X4 195 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TSKSQ9UJT2 592 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USTQ9Y2C2 406 aa2.97□□□□□ -1.93
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 POTEFA5A3E0 1075 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HOXA2O43364 376 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RNF40O75150 1001 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GUCA2AQ02747 115 aa2.96□□□□□ -1.94
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFAP70Q5T0N1 1121 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms