RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591760.5

PTPRS-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRS, Length 478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-209ENST00000591760 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.7■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 TRIM52Q96A61 297 aa38.69■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 TRPM2O94759 1503 aa38.68■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP38.67■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 TOM1O60784 492 aa38.66■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 BCANQ96GW7 911 aa38.66■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.66■■■■□ 3.78
PTPRS-209ENST00000591760 CLTCL1P53675 1640 aa38.61■■■■□ 3.77
PTPRS-209ENST00000591760 NWD1Q149M9 1564 aa38.59■■■■□ 3.77
PTPRS-209ENST00000591760 KCNA6P17658 529 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPRS-209ENST00000591760 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.57■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 DIP2AQ14689 1571 aa38.55■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 ALKQ9UM73 1620 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 KIF1BO60333 1816 aa38.54■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 PIP4K2BP78356 416 aa38.53■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.52■■■■□ 3.76
PTPRS-209ENST00000591760 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
PTPRS-209ENST00000591760 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
PTPRS-209ENST00000591760 TBX22Q9Y458 520 aa38.48■■■■□ 3.75
PTPRS-209ENST00000591760 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.47■■■■□ 3.75
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM94Q12767 1356 aa38.46■■■■□ 3.75
PTPRS-209ENST00000591760 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa38.43■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 SETD5Q9C0A6 1442 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 PIK3R4Q99570 1358 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa38.38■■■■□ 3.74
PTPRS-209ENST00000591760 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.35■■■■□ 3.73
PTPRS-209ENST00000591760 HSPA1LP34931 641 aa38.34■■■■□ 3.73
PTPRS-209ENST00000591760 FOXD1Q16676 465 aa38.32■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 CCDC144AA2RUR9 1427 aa38.29■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 MSH6P52701 1360 aa38.29■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa38.27■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa38.26■■■■□ 3.72
PTPRS-209ENST00000591760 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa38.25■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 PPLO60437 1756 aa38.24■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 PTPRUQ92729 1446 aa38.22■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 DISP3Q9P2K9 1392 aa38.22■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 VGFO15240 615 aaPredicted RBP38.21■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa38.2■■■■□ 3.71
PTPRS-209ENST00000591760 FAM135BQ49AJ0 1406 aa38.19■■■■□ 3.7
PTPRS-209ENST00000591760 METP08581 1390 aa38.17■■■■□ 3.7
PTPRS-209ENST00000591760 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa38.15■■■■□ 3.7
PTPRS-209ENST00000591760 C14orf37Q86TY3 774 aa38.15■■■■□ 3.7
PTPRS-209ENST00000591760 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa38.13■■■■□ 3.7
PTPRS-209ENST00000591760 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
PTPRS-209ENST00000591760 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
PTPRS-209ENST00000591760 IFT172Q9UG01 1749 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPRS-209ENST00000591760 C19orf44Q9H6X5 657 aa38.07■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 SLAIN2Q9P270 581 aa38.07■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa38.04■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 RGL3Q3MIN7 710 aa38.03■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 CADPS2Q86UW7 1296 aa38.03■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 HRCP23327 699 aa38.02■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 ATF3P18847 181 aa38.01■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 DCCP43146 1447 aa38.01■■■■□ 3.68
PTPRS-209ENST00000591760 PTCH1Q13635 1447 aa37.98■■■■□ 3.67
PTPRS-209ENST00000591760 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.95■■■■□ 3.67
PTPRS-209ENST00000591760 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.95■■■■□ 3.67
PTPRS-209ENST00000591760 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.94■■■■□ 3.66
PTPRS-209ENST00000591760 PHLPP1O60346 1717 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPRS-209ENST00000591760 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPRS-209ENST00000591760 PIK3C2GO75747 1445 aa37.89■■■■□ 3.66
PTPRS-209ENST00000591760 MYOM2P54296 1465 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPRS-209ENST00000591760 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.86■■■■□ 3.65
PTPRS-209ENST00000591760 MST1RQ04912 1400 aa37.82■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 ILDR2Q71H61 639 aa37.82■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 NRXN1Q9ULB1 1477 aa37.81■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 LAMC1P11047 1609 aa37.8■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.79■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 KNDC1Q76NI1 1749 aa37.77■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 TECPR2O15040 1411 aa37.77■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 BRINP3Q76B58 766 aa37.76■■■■□ 3.64
PTPRS-209ENST00000591760 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
PTPRS-209ENST00000591760 JCADQ9P266 1359 aa37.73■■■■□ 3.63
PTPRS-209ENST00000591760 ABCC11Q96J66 1382 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 STK26Q9P289 416 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP37.69■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.69■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 TMEM132EQ6IEE7 984 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.65■■■■□ 3.62
PTPRS-209ENST00000591760 SHPRHQ149N8 1683 aa37.63■■■■□ 3.61
PTPRS-209ENST00000591760 CFAP70Q5T0N1 1121 aa37.62■■■■□ 3.61
PTPRS-209ENST00000591760 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
PTPRS-209ENST00000591760 STAC3Q96MF2 364 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPRS-209ENST00000591760 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.59■■■■□ 3.61
PTPRS-209ENST00000591760 WAPLQ7Z5K2 1190 aa37.57■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms