RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589235.5

CIRBP-222, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,073 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-222	ENST00000589235	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.22	■■■□□ 2.75
CIRBP-222	ENST00000589235	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235		E9PCH4	1651 aa		32.18	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		32.16	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.15	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.14	■■■□□ 2.74
CIRBP-222	ENST00000589235	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CIRBP-222	ENST00000589235	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CIRBP-222	ENST00000589235	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.08	■■■□□ 2.73
CIRBP-222	ENST00000589235	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.07	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	NAIP	Q13075	1403 aa		32.06	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.02	■■■□□ 2.72
CIRBP-222	ENST00000589235	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.01	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	NWD1	Q149M9	1564 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	HFM1	A2PYH4	1435 aa		31.99	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	MSH6	P52701	1360 aa		31.97	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	PIK3R4	Q99570	1358 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		31.95	■■■□□ 2.71
CIRBP-222	ENST00000589235	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.94	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	DIP2A	Q14689	1571 aa		31.93	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		31.91	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	C14orf37	Q86TY3	774 aa		31.89	■■■□□ 2.7
CIRBP-222	ENST00000589235	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	SOCS7	O14512	581 aa		31.88	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	31.87	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	TRPM2	O94759	1503 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.86	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		31.85	■■■□□ 2.69
CIRBP-222	ENST00000589235	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		31.79	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	ATF3	P18847	181 aa		31.78	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.77	■■■□□ 2.68
CIRBP-222	ENST00000589235	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.75	■■■□□ 2.67
CIRBP-222	ENST00000589235	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.74	■■■□□ 2.67
CIRBP-222	ENST00000589235	KIF1B	O60333	1816 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-222	ENST00000589235	PTPRU	Q92729	1446 aa		31.72	■■■□□ 2.67
CIRBP-222	ENST00000589235	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.71	■■■□□ 2.67
CIRBP-222	ENST00000589235	MET	P08581	1390 aa		31.68	■■■□□ 2.66
CIRBP-222	ENST00000589235	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CIRBP-222	ENST00000589235	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		31.67	■■■□□ 2.66
CIRBP-222	ENST00000589235	FOXD1	Q16676	465 aa		31.64	■■■□□ 2.66
CIRBP-222	ENST00000589235	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	DCC	P43146	1447 aa		31.61	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.59	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.58	■■■□□ 2.65
CIRBP-222	ENST00000589235	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.56	■■■□□ 2.64
CIRBP-222	ENST00000589235	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.53	■■■□□ 2.64
CIRBP-222	ENST00000589235	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.51	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		31.49	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	PTCH1	Q13635	1447 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.48	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.46	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	MST1R	Q04912	1400 aa		31.45	■■■□□ 2.63
CIRBP-222	ENST00000589235	PPL	O60437	1756 aa		31.45	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.44	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.43	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		31.42	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.41	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		31.39	■■■□□ 2.62
CIRBP-222	ENST00000589235	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
CIRBP-222	ENST00000589235	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	31.37	■■■□□ 2.61
CIRBP-222	ENST00000589235	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CIRBP-222	ENST00000589235	STK26	Q9P289	416 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CIRBP-222	ENST00000589235	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.33	■■■□□ 2.61
CIRBP-222	ENST00000589235	HRC	P23327	699 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.32	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.29	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.28	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		31.27	■■■□□ 2.6
CIRBP-222	ENST00000589235	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CIRBP-222	ENST00000589235	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.25	■■■□□ 2.59
CIRBP-222	ENST00000589235	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
CIRBP-222	ENST00000589235	TECPR2	O15040	1411 aa		31.24	■■■□□ 2.59
CIRBP-222	ENST00000589235	LRP6	O75581	1613 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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