RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-205ENST00000588337 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.69■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.66■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 NWD1Q149M9 1564 aa40.65■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 PIP4K2BP78356 416 aa40.65■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
KDM4B-205ENST00000588337 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 BCANQ96GW7 911 aa40.59■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 KCNA6P17658 529 aa40.58■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 TRPM2O94759 1503 aa40.57■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 CLTCL1P53675 1640 aa40.57■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
KDM4B-205ENST00000588337 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.56■■■■■ 4.08
KDM4B-205ENST00000588337 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
KDM4B-205ENST00000588337 DIP2AQ14689 1571 aa40.52■■■■■ 4.08
KDM4B-205ENST00000588337 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
KDM4B-205ENST00000588337 TMEM94Q12767 1356 aa40.5■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 HSPA1LP34931 641 aa40.5■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 TRIM52Q96A61 297 aa40.49■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.49■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 KIF1BO60333 1816 aa40.48■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.48■■■■■ 4.07
KDM4B-205ENST00000588337 TBX22Q9Y458 520 aa40.44■■■■■ 4.06
KDM4B-205ENST00000588337 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.42■■■■■ 4.06
KDM4B-205ENST00000588337 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
KDM4B-205ENST00000588337 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.38■■■■■ 4.06
KDM4B-205ENST00000588337 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
KDM4B-205ENST00000588337 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
KDM4B-205ENST00000588337 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.37■■■■■ 4.05
KDM4B-205ENST00000588337 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
KDM4B-205ENST00000588337 PIK3R4Q99570 1358 aa40.34■■■■■ 4.05
KDM4B-205ENST00000588337 MSH6P52701 1360 aa40.27■■■■■ 4.04
KDM4B-205ENST00000588337 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
KDM4B-205ENST00000588337 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.25■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.25■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 PTPRUQ92729 1446 aa40.25■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.24■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.21■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 FOXD1Q16676 465 aa40.2■■■■■ 4.03
KDM4B-205ENST00000588337 PPLO60437 1756 aa40.19■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 ILDR2Q71H61 639 aa40.16■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.16■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.16■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.14■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 METP08581 1390 aa40.13■■■■■ 4.02
KDM4B-205ENST00000588337 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.09■■■■■ 4.01
KDM4B-205ENST00000588337 C14orf37Q86TY3 774 aa40.08■■■■■ 4.01
KDM4B-205ENST00000588337 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.07■■■■■ 4
KDM4B-205ENST00000588337 SLAIN2Q9P270 581 aa40.06■■■■■ 4
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KDM4B-205ENST00000588337 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.03■■■■■ 4
KDM4B-205ENST00000588337 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.01■■■■■ 4
KDM4B-205ENST00000588337 PHLPP1O60346 1717 aa40.01■■■■■ 4
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KDM4B-205ENST00000588337 DCCP43146 1447 aa39.96■■■■□ 3.99
KDM4B-205ENST00000588337 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.96■■■■□ 3.99
KDM4B-205ENST00000588337 ATF3P18847 181 aa39.95■■■■□ 3.99
KDM4B-205ENST00000588337 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
KDM4B-205ENST00000588337 PTCH1Q13635 1447 aa39.9■■■■□ 3.98
KDM4B-205ENST00000588337 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.89■■■■□ 3.98
KDM4B-205ENST00000588337 RGL3Q3MIN7 710 aa39.88■■■■□ 3.97
KDM4B-205ENST00000588337 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.88■■■■□ 3.97
KDM4B-205ENST00000588337 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
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KDM4B-205ENST00000588337 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.84■■■■□ 3.97
KDM4B-205ENST00000588337 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
KDM4B-205ENST00000588337 MST1RQ04912 1400 aa39.82■■■■□ 3.97
KDM4B-205ENST00000588337 ROBO2Q9HCK4 1378 aa39.82■■■■□ 3.96
KDM4B-205ENST00000588337 SOCS7O14512 581 aa39.79■■■■□ 3.96
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KDM4B-205ENST00000588337 PIK3C2GO75747 1445 aa39.76■■■■□ 3.96
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KDM4B-205ENST00000588337 JCADQ9P266 1359 aa39.75■■■■□ 3.95
KDM4B-205ENST00000588337 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.73■■■■□ 3.95
KDM4B-205ENST00000588337 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.71■■■■□ 3.95
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KDM4B-205ENST00000588337 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.67■■■■□ 3.94
KDM4B-205ENST00000588337 TECPR2O15040 1411 aa39.65■■■■□ 3.94
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KDM4B-205ENST00000588337 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.62■■■■□ 3.93
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KDM4B-205ENST00000588337 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.58■■■■□ 3.93
KDM4B-205ENST00000588337 STK26Q9P289 416 aa39.57■■■■□ 3.93
KDM4B-205ENST00000588337 LRP6O75581 1613 aa39.56■■■■□ 3.92
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC11Q96J66 1382 aa39.56■■■■□ 3.92
KDM4B-205ENST00000588337 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.56■■■■□ 3.92
KDM4B-205ENST00000588337 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.54■■■■□ 3.92
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KDM4B-205ENST00000588337 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.49■■■■□ 3.91
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