RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 HDGFP51858 240 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PIP4K2BP78356 416 aa45.77■■■■■ 4.92
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP45.76■■■■■ 4.92
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP45.73■■■■■ 4.91
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP45.7■■■■■ 4.91
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CTDNEP1-206ENST00000571409 DIP2AQ14689 1571 aa45.5■■■■■ 4.87
CTDNEP1-206ENST00000571409 DISP3Q9P2K9 1392 aa45.49■■■■■ 4.87
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa45.35■■■■■ 4.85
CTDNEP1-206ENST00000571409 MSH6P52701 1360 aa45.32■■■■■ 4.84
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PTPRUQ92729 1446 aa45.26■■■■■ 4.84
CTDNEP1-206ENST00000571409 SETD5Q9C0A6 1442 aa45.26■■■■■ 4.84
CTDNEP1-206ENST00000571409 MPHOSPH9Q99550 1183 aa45.25■■■■■ 4.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM135BQ49AJ0 1406 aa45.24■■■■■ 4.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa45.23■■■■■ 4.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa45.22■■■■■ 4.83
CTDNEP1-206ENST00000571409 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa45.18■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 C14orf37Q86TY3 774 aa45.17■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
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CTDNEP1-206ENST00000571409 METP08581 1390 aa45.16■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC144AA2RUR9 1427 aa45.15■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 VGFO15240 615 aaPredicted RBP45.14■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa45.14■■■■■ 4.82
CTDNEP1-206ENST00000571409 ILDR2Q71H61 639 aa45.12■■■■■ 4.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPLO60437 1756 aa45.12■■■■■ 4.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLAIN2Q9P270 581 aa45.11■■■■■ 4.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa45.09■■■■■ 4.81
CTDNEP1-206ENST00000571409 C19orf44Q9H6X5 657 aa45.06■■■■■ 4.8
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CTDNEP1-206ENST00000571409 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa45■■■■■ 4.79
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CTDNEP1-206ENST00000571409 IFT172Q9UG01 1749 aa44.92■■■■■ 4.78
CTDNEP1-206ENST00000571409 DCCP43146 1447 aa44.92■■■■■ 4.78
CTDNEP1-206ENST00000571409 PHLPP1O60346 1717 aa44.91■■■■■ 4.78
CTDNEP1-206ENST00000571409 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa44.87■■■■■ 4.77
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CTDNEP1-206ENST00000571409 PTCH1Q13635 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
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CTDNEP1-206ENST00000571409 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa44.68■■■■■ 4.74
CTDNEP1-206ENST00000571409 MYOM2P54296 1465 aa44.62■■■■■ 4.73
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CTDNEP1-206ENST00000571409 ABCC11Q96J66 1382 aa44.53■■■■■ 4.72
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CTDNEP1-206ENST00000571409 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP44.52■■■■■ 4.72
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CTDNEP1-206ENST00000571409 WAPLQ7Z5K2 1190 aa44.49■■■■■ 4.71
CTDNEP1-206ENST00000571409 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa44.49■■■■■ 4.71
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CTDNEP1-206ENST00000571409 CFAP70Q5T0N1 1121 aa44.48■■■■■ 4.71
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