RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TOM1	O60784	492 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PPP4C-205	ENST00000563200	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
PPP4C-205	ENST00000563200	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-205	ENST00000563200	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA6	P17658	529 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPM2	O94759	1503 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.75	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		32.74	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	TBX22	Q9Y458	520 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.72	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
PPP4C-205	ENST00000563200	DIP2A	Q14689	1571 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA1L	P34931	641 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF1B	O60333	1816 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PPP4C-205	ENST00000563200	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3R4	Q99570	1358 aa		32.63	■■■□□ 2.81
PPP4C-205	ENST00000563200	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-205	ENST00000563200	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		32.62	■■■□□ 2.81
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
PPP4C-205	ENST00000563200	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.56	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXD1	Q16676	465 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	PTPRU	Q92729	1446 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		32.52	■■■□□ 2.8
PPP4C-205	ENST00000563200	MSH6	P52701	1360 aa		32.51	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		32.49	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	MET	P08581	1390 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		32.46	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	PPL	O60437	1756 aa		32.45	■■■□□ 2.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.4	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
PPP4C-205	ENST00000563200	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.38	■■■□□ 2.77
PPP4C-205	ENST00000563200	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		32.37	■■■□□ 2.77
PPP4C-205	ENST00000563200	ILDR2	Q71H61	639 aa		32.36	■■■□□ 2.77
PPP4C-205	ENST00000563200	C14orf37	Q86TY3	774 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT172	Q9UG01	1749 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	DCC	P43146	1447 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ATF3	P18847	181 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.26	■■■□□ 2.76
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	HRC	P23327	699 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3C2G	O75747	1445 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-205	ENST00000563200	MST1R	Q04912	1400 aa		32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-205	ENST00000563200	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
PPP4C-205	ENST00000563200	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PPP4C-205	ENST00000563200	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PPP4C-205	ENST00000563200	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		32.11	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOM2	P54296	1465 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	TECPR2	O15040	1411 aa		32.09	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PPP4C-205	ENST00000563200	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	32.06	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS7	O14512	581 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	ABCC11	Q96J66	1382 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PPP4C-205	ENST00000563200	LAMC1	P11047	1609 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	STK26	Q9P289	416 aa		32	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.93	■■■□□ 2.7

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