RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 NGLY1Q96IV0 654 aa10.96□□□□□ -0.65
CS-212ENST00000548567 ERVK-7P63135 1459 aa10.96□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 RIMS2Q9UQ26 1411 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 ABCC3O15438 1527 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 METP08581 1390 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 POTEAQ6S8J7 498 aa10.95□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 PZPP20742 1482 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.94□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 STRCQ7RTU9 1775 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 CEP152O94986 1710 aa10.93□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 MSH6P52701 1360 aa10.92□□□□□ -0.66
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CS-212ENST00000548567 ERBINQ96RT1 1412 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 NBPF1Q3BBV0 1214 aa10.92□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
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CS-212ENST00000548567 C19orf44Q9H6X5 657 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 AGLP35573 1532 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 NAIPQ13075 1403 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-212ENST00000548567 BRINP3Q76B58 766 aa10.9□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP10.89□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 NOS1P29475 1434 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 CHRNA2Q15822 529 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 PSME1Q06323 249 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 STRN4Q9NRL3 753 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 TMC1Q8TDI8 760 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 ADGBQ8N7X0 1667 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 TBX22Q9Y458 520 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 CCDC144AA2RUR9 1427 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 PLXNC1O60486 1568 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 PTPRTO14522 1441 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 CABP2Q9NPB3 220 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 FBLN1P23142 703 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-212ENST00000548567 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
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CS-212ENST00000548567 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 NLRP1Q9C000 1473 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 L3MBTL2Q969R5 705 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 PIK3C2BO00750 1634 aa10.82□□□□□ -0.68
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CS-212ENST00000548567 ARHGEF5Q12774 1597 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP10.82□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 PTPRUQ92729 1446 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 AFF2P51816 1311 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 USP21Q9UK80 565 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 PCNTO95613 3336 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 MAP3K1Q13233 1512 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 PLA2R1Q13018 1463 aa10.77□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
CS-212ENST00000548567 SYNMO15061 1565 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 RXRBP28702 533 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 DEFB132Q7Z7B7 95 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 ROCK1Q13464 1354 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
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CS-212ENST00000548567 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
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CS-212ENST00000548567 EVA1CP58658 441 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-212ENST00000548567 CARD11Q9BXL7 1154 aa10.72□□□□□ -0.69
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