RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.47■■□□□ 1.67
CASP9-211ENST00000546969 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.44■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.44■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 TRIM52Q96A61 297 aa25.43■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.42■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 HSPA1LP34931 641 aa25.41■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.4■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 ZFYVE9O95405 1425 aa25.4■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 NAIPQ13075 1403 aa25.4■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CASP9-211ENST00000546969 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 TBX22Q9Y458 520 aa25.38■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 TMEM94Q12767 1356 aa25.36■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 HFM1A2PYH4 1435 aa25.36■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.33■■□□□ 1.65
CASP9-211ENST00000546969 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 MSH6P52701 1360 aa25.31■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 C14orf37Q86TY3 774 aa25.29■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 PIK3R4Q99570 1358 aa25.28■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 NWD1Q149M9 1564 aa25.27■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 DIP2AQ14689 1571 aa25.27■■□□□ 1.64
CASP9-211ENST00000546969 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 ALKQ9UM73 1620 aa25.25■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 TRPM2O94759 1503 aa25.23■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.22■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.21■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.21■■□□□ 1.63
CASP9-211ENST00000546969 KIF1BO60333 1816 aa25.2■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.19■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 SLAIN2Q9P270 581 aa25.18■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 CLTCL1P53675 1640 aa25.17■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 ATF3P18847 181 aa25.17■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 ILDR2Q71H61 639 aa25.16■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.16■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.15■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.15■■□□□ 1.62
CASP9-211ENST00000546969 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.12■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.11■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 SOCS7O14512 581 aa25.09■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.08■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.08■■□□□ 1.61
CASP9-211ENST00000546969 FOXD1Q16676 465 aa25.07■■□□□ 1.6
CASP9-211ENST00000546969 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.06■■□□□ 1.6
CASP9-211ENST00000546969 PTPRUQ92729 1446 aa25.05■■□□□ 1.6
CASP9-211ENST00000546969 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.04■■□□□ 1.6
CASP9-211ENST00000546969 METP08581 1390 aa25.04■■□□□ 1.6
CASP9-211ENST00000546969 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 RGL3Q3MIN7 710 aa25■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 DCCP43146 1447 aa25■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 PHLPP1O60346 1717 aa24.97■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 JCADQ9P266 1359 aa24.96■■□□□ 1.59
CASP9-211ENST00000546969 PPLO60437 1756 aa24.93■■□□□ 1.58
CASP9-211ENST00000546969 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.93■■□□□ 1.58
CASP9-211ENST00000546969 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
CASP9-211ENST00000546969 PTCH1Q13635 1447 aa24.9■■□□□ 1.58
CASP9-211ENST00000546969 BRINP3Q76B58 766 aa24.9■■□□□ 1.58
CASP9-211ENST00000546969 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.88■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.87■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 HRCP23327 699 aa24.85■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 MST1RQ04912 1400 aa24.85■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.83■■□□□ 1.57
CASP9-211ENST00000546969 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 STK26Q9P289 416 aa24.82■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.81■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.81■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.78■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.77■■□□□ 1.56
CASP9-211ENST00000546969 IFT172Q9UG01 1749 aa24.76■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 PIK3C2GO75747 1445 aa24.76■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.75■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 ABCC11Q96J66 1382 aa24.75■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 SHPRHQ149N8 1683 aa24.72■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 STAC3Q96MF2 364 aa24.72■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 TECPR2O15040 1411 aa24.71■■□□□ 1.55
CASP9-211ENST00000546969 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.71■■□□□ 1.55
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