RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524226.5

PCM1-222, Transcript of pericentriolar material 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCM1, Length 5,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCM1-222	ENST00000524226	BECN1	Q14457	450 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	KDM5C	P41229	1560 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	RALBP1	Q15311	655 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MSH5	O43196	834 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	RAPGEF3	O95398	923 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226		E9PCH4	1651 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	DEPDC5	O75140	1603 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CEP152	O94986	1710 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	GLI2	P10070	1586 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ATP10A	O60312	1499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	KIF1B	O60333	1816 aa		3.36	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	NRDC	O43847	1150 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ATF3	P18847	181 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	LAMC1	P11047	1609 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CLTCL1	P53675	1640 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PTPRT	O14522	1441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	EVA1C	P58658	441 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ABCA6	Q8N139	1617 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	TSPOAP1	O95153	1857 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	FKBP8	Q14318	412 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MYOM2	P54296	1465 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PLA2R1	Q13018	1463 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	ABCC3	O15438	1527 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	MADD	Q8WXG6	1647 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PCM1-222	ENST00000524226	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NOS1	P29475	1434 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	DIP2B	Q9P265	1576 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226		G3V3G9	751 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		3.34	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	PANK3	Q9H999	370 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	CASC1	Q6TDU7	716 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NLRP13	Q86W25	1043 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NPAT	Q14207	1427 aa		3.33	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	GOLGA2	Q08379	1002 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	EVC2	Q86UK5	1308 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	ADGRB3	O60242	1522 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	RICTOR	Q6R327	1708 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
PCM1-222	ENST00000524226	CFAP44	Q96MT7	982 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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