RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517924.5

LAPTM4B-202, Transcript of lysosomal protein transmembrane 4 beta, humanhuman

TSL 5

Gene LAPTM4B, Length 618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4B-202ENST00000517924 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.55
LAPTM4B-202ENST00000517924 ALKQ9UM73 1620 aa37.25■■■■□ 3.55
LAPTM4B-202ENST00000517924 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIP4K2BP78356 416 aa37.18■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRIM52Q96A61 297 aa37.18■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 BCANQ96GW7 911 aa37.18■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.17■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 CLTCL1P53675 1640 aa37.17■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 TOM1O60784 492 aa37.16■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
LAPTM4B-202ENST00000517924 TRPM2O94759 1503 aa37.12■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 KCNA6P17658 529 aa37.11■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 NWD1Q149M9 1564 aa37.11■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.1■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.08■■■■□ 3.53
LAPTM4B-202ENST00000517924 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.05■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 KIF1BO60333 1816 aa37.05■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.04■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM94Q12767 1356 aa37.04■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 HSPA1LP34931 641 aa37.02■■■■□ 3.52
LAPTM4B-202ENST00000517924 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 TBX22Q9Y458 520 aa36.99■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.98■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 DIP2AQ14689 1571 aa36.97■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 FOXD1Q16676 465 aa36.97■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.95■■■■□ 3.51
LAPTM4B-202ENST00000517924 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.91■■■■□ 3.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.89■■■■□ 3.5
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTPRUQ92729 1446 aa36.87■■■■□ 3.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.86■■■■□ 3.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 MPHOSPH9Q99550 1183 aa36.85■■■■□ 3.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIK3R4Q99570 1358 aa36.83■■■■□ 3.49
LAPTM4B-202ENST00000517924 PPLO60437 1756 aa36.8■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 METP08581 1390 aa36.78■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 MSH6P52701 1360 aa36.78■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.77■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.77■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa36.77■■■■□ 3.48
LAPTM4B-202ENST00000517924 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 FAM135BQ49AJ0 1406 aa36.72■■■■□ 3.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.71■■■■□ 3.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
LAPTM4B-202ENST00000517924 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa36.68■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 ILDR2Q71H61 639 aa36.67■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 C14orf37Q86TY3 774 aa36.67■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.66■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa36.66■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 IFT172Q9UG01 1749 aa36.65■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 SLAIN2Q9P270 581 aa36.64■■■■□ 3.46
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGL3Q3MIN7 710 aa36.63■■■■□ 3.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 C19orf44Q9H6X5 657 aa36.59■■■■□ 3.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.57■■■■□ 3.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHLPP1O60346 1717 aa36.54■■■■□ 3.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 NALCNQ8IZF0 1738 aa36.54■■■■□ 3.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ATF3P18847 181 aa36.52■■■■□ 3.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 CADPS2Q86UW7 1296 aa36.52■■■■□ 3.44
LAPTM4B-202ENST00000517924 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.47■■■■□ 3.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 DCCP43146 1447 aa36.46■■■■□ 3.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa36.46■■■■□ 3.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa36.45■■■■□ 3.43
LAPTM4B-202ENST00000517924 PTCH1Q13635 1447 aa36.44■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 MST1RQ04912 1400 aa36.41■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.4■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 PIK3C2GO75747 1445 aa36.4■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.4■■■■□ 3.42
LAPTM4B-202ENST00000517924 HRCP23327 699 aa36.38■■■■□ 3.41
LAPTM4B-202ENST00000517924 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
LAPTM4B-202ENST00000517924 BRINP3Q76B58 766 aa36.37■■■■□ 3.41
LAPTM4B-202ENST00000517924 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.33■■■■□ 3.41
LAPTM4B-202ENST00000517924 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
LAPTM4B-202ENST00000517924 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.31■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 STK26Q9P289 416 aa36.31■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 MYOM2P54296 1465 aa36.31■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.28■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.28■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 JCADQ9P266 1359 aa36.27■■■■□ 3.4
LAPTM4B-202ENST00000517924 TECPR2O15040 1411 aa36.25■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 C1orf167Q5SNV9 1468 aa36.24■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.23■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.23■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 LAMC1P11047 1609 aa36.23■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 SOCS7O14512 581 aa36.21■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 SHPRHQ149N8 1683 aa36.21■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 ABCC11Q96J66 1382 aa36.21■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
LAPTM4B-202ENST00000517924 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.21■■■■□ 3.39
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