RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 PIP4K2BP78356 416 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 BCANQ96GW7 911 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 ALKQ9UM73 1620 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 KCNA6P17658 529 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM52Q96A61 297 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRU-207ENST00000492954 HSPA1LP34931 641 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM94Q12767 1356 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 NWD1Q149M9 1564 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 TRPM2O94759 1503 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-207ENST00000492954 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 TBX22Q9Y458 520 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 CLTCL1P53675 1640 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 DIP2AQ14689 1571 aa27.01■■□□□ 1.92
PTPRU-207ENST00000492954 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PTPRU-207ENST00000492954 PIK3R4Q99570 1358 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRU-207ENST00000492954 FOXD1Q16676 465 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRU-207ENST00000492954 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 MSH6P52701 1360 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 PTPRUQ92729 1446 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 KIF1BO60333 1816 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRU-207ENST00000492954 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.89■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 ILDR2Q71H61 639 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 METP08581 1390 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 C14orf37Q86TY3 774 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 SLAIN2Q9P270 581 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRU-207ENST00000492954 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTPRU-207ENST00000492954 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 ATF3P18847 181 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 RGL3Q3MIN7 710 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.75■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 PPLO60437 1756 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRU-207ENST00000492954 DCCP43146 1447 aa26.69■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 PTCH1Q13635 1447 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 PHLPP1O60346 1717 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRU-207ENST00000492954 IFT172Q9UG01 1749 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 BRINP3Q76B58 766 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 MST1RQ04912 1400 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 SOCS7O14512 581 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.61■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 JCADQ9P266 1359 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 PIK3C2GO75747 1445 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRU-207ENST00000492954 HRCP23327 699 aa26.57■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.56■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 STK26Q9P289 416 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PTPRU-207ENST00000492954 MYOM2P54296 1465 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 TECPR2O15040 1411 aa26.49■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 ABCC11Q96J66 1382 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 WAPLQ7Z5K2 1190 aa26.47■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRU-207ENST00000492954 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRU-207ENST00000492954 ORAI2Q96SN7 254 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRU-207ENST00000492954 LRP6O75581 1613 aa26.43■■□□□ 1.82
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