RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491236.1

RBM3-210, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene RBM3, Length 729 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-210ENST00000491236 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 ILDR2Q71H61 639 aa28.18■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 TMEM94Q12767 1356 aa28.17■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.16■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 TRIM52Q96A61 297 aa28.14■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 TBX22Q9Y458 520 aa28.14■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 ZFYVE9O95405 1425 aa28.14■■■□□ 2.1
RBM3-210ENST00000491236 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
RBM3-210ENST00000491236 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.1■■■□□ 2.09
RBM3-210ENST00000491236 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.1■■■□□ 2.09
RBM3-210ENST00000491236 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.08■■■□□ 2.09
RBM3-210ENST00000491236 NAIPQ13075 1403 aa28.07■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.05■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 E9PCH4 1651 aa28.05■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 C14orf37Q86TY3 774 aa28.05■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 ALKQ9UM73 1620 aa28.04■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 MSH6P52701 1360 aa28.03■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
RBM3-210ENST00000491236 SOCS7O14512 581 aa28.01■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 HFM1A2PYH4 1435 aa27.98■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 SLAIN2Q9P270 581 aa27.97■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.96■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.96■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 PIK3R4Q99570 1358 aa27.96■■■□□ 2.07
RBM3-210ENST00000491236 NWD1Q149M9 1564 aa27.91■■■□□ 2.06
RBM3-210ENST00000491236 ATF3P18847 181 aa27.91■■■□□ 2.06
RBM3-210ENST00000491236 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.9■■■□□ 2.06
RBM3-210ENST00000491236 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.9■■■□□ 2.06
RBM3-210ENST00000491236 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.89■■■□□ 2.06
RBM3-210ENST00000491236 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
RBM3-210ENST00000491236 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
RBM3-210ENST00000491236 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.85■■■□□ 2.05
RBM3-210ENST00000491236 DIP2AQ14689 1571 aa27.85■■■□□ 2.05
RBM3-210ENST00000491236 TRPM2O94759 1503 aa27.82■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 FOXD1Q16676 465 aa27.82■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.81■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 PTPRUQ92729 1446 aa27.81■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.8■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 METP08581 1390 aa27.79■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.79■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
RBM3-210ENST00000491236 CLTCL1P53675 1640 aa27.75■■■□□ 2.03
RBM3-210ENST00000491236 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
RBM3-210ENST00000491236 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.73■■■□□ 2.03
RBM3-210ENST00000491236 RGL3Q3MIN7 710 aa27.72■■■□□ 2.03
RBM3-210ENST00000491236 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
RBM3-210ENST00000491236 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.7■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 JCADQ9P266 1359 aa27.7■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.69■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 BRINP3Q76B58 766 aa27.67■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.65■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 DCCP43146 1447 aa27.64■■■□□ 2.02
RBM3-210ENST00000491236 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.63■■■□□ 2.01
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RBM3-210ENST00000491236 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.58■■■□□ 2.01
RBM3-210ENST00000491236 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
RBM3-210ENST00000491236 KIF1BO60333 1816 aa27.58■■■□□ 2.01
RBM3-210ENST00000491236 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.58■■■□□ 2.01
RBM3-210ENST00000491236 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.57■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.56■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 POTEAQ6S8J7 498 aa27.55■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 STK26Q9P289 416 aa27.55■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 MST1RQ04912 1400 aa27.55■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 PHLPP1O60346 1717 aa27.54■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 PTCH1Q13635 1447 aa27.53■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.53■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.52■■■□□ 2
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RBM3-210ENST00000491236 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
RBM3-210ENST00000491236 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.48■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.47■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 ORAI2Q96SN7 254 aa27.46■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.45■■□□□ 1.99
RBM3-210ENST00000491236 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.44■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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RBM3-210ENST00000491236 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.41■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 ABCC11Q96J66 1382 aa27.39■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 HRCP23327 699 aa27.39■■□□□ 1.98
RBM3-210ENST00000491236 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.38■■□□□ 1.97
RBM3-210ENST00000491236 LRP6O75581 1613 aa27.38■■□□□ 1.97
RBM3-210ENST00000491236 NUTM2FA1L443 756 aa27.37■■□□□ 1.97
RBM3-210ENST00000491236 PIK3C2GO75747 1445 aa27.37■■□□□ 1.97
RBM3-210ENST00000491236 PPLO60437 1756 aa27.37■■□□□ 1.97
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