RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-216ENST00000489424 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.04■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.04■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 PIP4K2BP78356 416 aa26.03■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 TBX22Q9Y458 520 aa26.02■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.02■■□□□ 1.76
HDAC10-216ENST00000489424 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
HDAC10-216ENST00000489424 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.98■■□□□ 1.75
HDAC10-216ENST00000489424 PIK3R4Q99570 1358 aa25.96■■□□□ 1.75
HDAC10-216ENST00000489424 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
HDAC10-216ENST00000489424 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 ALKQ9UM73 1620 aa25.95■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 ILDR2Q71H61 639 aa25.94■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 BCANQ96GW7 911 aa25.94■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 HSPA1LP34931 641 aa25.93■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.93■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 NWD1Q149M9 1564 aa25.91■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 TMEM94Q12767 1356 aa25.9■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 TRIM52Q96A61 297 aa25.89■■□□□ 1.74
HDAC10-216ENST00000489424 DIP2AQ14689 1571 aa25.89■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 TRPM2O94759 1503 aa25.88■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.87■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.86■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.83■■□□□ 1.73
HDAC10-216ENST00000489424 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
HDAC10-216ENST00000489424 MSH6P52701 1360 aa25.8■■□□□ 1.72
HDAC10-216ENST00000489424 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HDAC10-216ENST00000489424 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HDAC10-216ENST00000489424 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.78■■□□□ 1.72
HDAC10-216ENST00000489424 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 CLTCL1P53675 1640 aa25.74■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.74■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.73■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.73■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 SLAIN2Q9P270 581 aa25.72■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.71■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.71■■□□□ 1.71
HDAC10-216ENST00000489424 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.7■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 SOCS7O14512 581 aa25.69■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 HRCP23327 699 aa25.68■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 KIF1BO60333 1816 aa25.67■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 PTPRUQ92729 1446 aa25.67■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.66■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.65■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 DCCP43146 1447 aa25.65■■□□□ 1.7
HDAC10-216ENST00000489424 METP08581 1390 aa25.64■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 ATF3P18847 181 aa25.63■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.63■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 C14orf37Q86TY3 774 aa25.62■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.62■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.6■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.59■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HDAC10-216ENST00000489424 FOXD1Q16676 465 aa25.57■■□□□ 1.68
HDAC10-216ENST00000489424 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HDAC10-216ENST00000489424 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.56■■□□□ 1.68
HDAC10-216ENST00000489424 PTCH1Q13635 1447 aa25.54■■□□□ 1.68
HDAC10-216ENST00000489424 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.68
HDAC10-216ENST00000489424 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.51■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 PHLPP1O60346 1717 aa25.51■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 PPLO60437 1756 aa25.49■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 JCADQ9P266 1359 aa25.48■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 STAC3Q96MF2 364 aa25.48■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 RGL3Q3MIN7 710 aa25.47■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.46■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 BRINP3Q76B58 766 aa25.46■■□□□ 1.67
HDAC10-216ENST00000489424 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 MST1RQ04912 1400 aa25.44■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 SIRT1Q96EB6 747 aa25.43■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.43■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 TECPR2O15040 1411 aa25.42■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 PIK3C2GO75747 1445 aa25.42■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 ABCC11Q96J66 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.41■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
HDAC10-216ENST00000489424 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.39■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 MYOM2P54296 1465 aa25.38■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 IFT172Q9UG01 1749 aa25.36■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.35■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.34■■□□□ 1.65
HDAC10-216ENST00000489424 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.31■■□□□ 1.64
HDAC10-216ENST00000489424 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HDAC10-216ENST00000489424 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
HDAC10-216ENST00000489424 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HDAC10-216ENST00000489424 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.26■■□□□ 1.63
HDAC10-216ENST00000489424 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.26■■□□□ 1.63
HDAC10-216ENST00000489424 LAMC1P11047 1609 aa25.26■■□□□ 1.63
HDAC10-216ENST00000489424 POTEAQ6S8J7 498 aa25.25■■□□□ 1.63
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