RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-209ENST00000479976 BCANQ96GW7 911 aa43.2■■■■■ 4.51
CHTF18-209ENST00000479976 ZFYVE9O95405 1425 aa43.2■■■■■ 4.51
CHTF18-209ENST00000479976 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
CHTF18-209ENST00000479976 KCNA6P17658 529 aa43.19■■■■■ 4.5
CHTF18-209ENST00000479976 RIMS2Q9UQ26 1411 aa43.17■■■■■ 4.5
CHTF18-209ENST00000479976 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
CHTF18-209ENST00000479976 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa43.13■■■■■ 4.49
CHTF18-209ENST00000479976 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
CHTF18-209ENST00000479976 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.49
CHTF18-209ENST00000479976 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
CHTF18-209ENST00000479976 NAIPQ13075 1403 aa43.08■■■■■ 4.49
CHTF18-209ENST00000479976 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
CHTF18-209ENST00000479976 TMEM94Q12767 1356 aa43.05■■■■■ 4.48
CHTF18-209ENST00000479976 ILDR2Q71H61 639 aa43.04■■■■■ 4.48
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
CHTF18-209ENST00000479976 TBX22Q9Y458 520 aa43■■■■■ 4.47
CHTF18-209ENST00000479976 NWD1Q149M9 1564 aa42.99■■■■■ 4.47
CHTF18-209ENST00000479976 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
CHTF18-209ENST00000479976 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.97■■■■■ 4.47
CHTF18-209ENST00000479976 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CHTF18-209ENST00000479976 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
CHTF18-209ENST00000479976 HFM1A2PYH4 1435 aa42.93■■■■■ 4.46
CHTF18-209ENST00000479976 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa42.88■■■■■ 4.46
CHTF18-209ENST00000479976 TRIM52Q96A61 297 aa42.88■■■■■ 4.45
CHTF18-209ENST00000479976 FAM135BQ49AJ0 1406 aa42.84■■■■■ 4.45
CHTF18-209ENST00000479976 DIP2AQ14689 1571 aa42.83■■■■■ 4.45
CHTF18-209ENST00000479976 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
CHTF18-209ENST00000479976 MSH6P52701 1360 aa42.8■■■■■ 4.44
CHTF18-209ENST00000479976 PIK3R4Q99570 1358 aa42.8■■■■■ 4.44
CHTF18-209ENST00000479976 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
CHTF18-209ENST00000479976 TRPM2O94759 1503 aa42.78■■■■■ 4.44
CHTF18-209ENST00000479976 CLTCL1P53675 1640 aa42.76■■■■■ 4.44
CHTF18-209ENST00000479976 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.75■■■■■ 4.43
CHTF18-209ENST00000479976 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa42.73■■■■■ 4.43
CHTF18-209ENST00000479976 SOCS7O14512 581 aa42.72■■■■■ 4.43
CHTF18-209ENST00000479976 SLAIN2Q9P270 581 aa42.7■■■■■ 4.43
CHTF18-209ENST00000479976 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa42.69■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa42.67■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 KIF1BO60333 1816 aa42.67■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa42.67■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 C14orf37Q86TY3 774 aa42.66■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 PTPRUQ92729 1446 aa42.65■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa42.65■■■■■ 4.42
CHTF18-209ENST00000479976 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa42.62■■■■■ 4.41
CHTF18-209ENST00000479976 C19orf44Q9H6X5 657 aa42.61■■■■■ 4.41
CHTF18-209ENST00000479976 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
CHTF18-209ENST00000479976 METP08581 1390 aa42.55■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 CADPS2Q86UW7 1296 aa42.55■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 VGFO15240 615 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 ATF3P18847 181 aa42.53■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 FOXD1Q16676 465 aa42.53■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
CHTF18-209ENST00000479976 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa42.5■■■■■ 4.39
CHTF18-209ENST00000479976 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
CHTF18-209ENST00000479976 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.47■■■■■ 4.39
CHTF18-209ENST00000479976 PHLPP1O60346 1717 aa42.42■■■■■ 4.38
CHTF18-209ENST00000479976 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
CHTF18-209ENST00000479976 DCCP43146 1447 aa42.37■■■■■ 4.37
CHTF18-209ENST00000479976 CCDC144AA2RUR9 1427 aa42.37■■■■■ 4.37
CHTF18-209ENST00000479976 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.35■■■■■ 4.37
CHTF18-209ENST00000479976 PPLO60437 1756 aa42.34■■■■■ 4.37
CHTF18-209ENST00000479976 JCADQ9P266 1359 aa42.31■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 BRINP3Q76B58 766 aa42.29■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 RGL3Q3MIN7 710 aa42.28■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa42.27■■■■■ 4.36
CHTF18-209ENST00000479976 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa42.25■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 MST1RQ04912 1400 aa42.23■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 PTCH1Q13635 1447 aa42.21■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa42.2■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 ROBO2Q9HCK4 1378 aa42.2■■■■■ 4.35
CHTF18-209ENST00000479976 NALCNQ8IZF0 1738 aa42.18■■■■■ 4.34
CHTF18-209ENST00000479976 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.18■■■■■ 4.34
CHTF18-209ENST00000479976 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.17■■■■■ 4.34
CHTF18-209ENST00000479976 PRAG1Q86YV5 1406 aa42.17■■■■■ 4.34
CHTF18-209ENST00000479976 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa42.15■■■■■ 4.34
CHTF18-209ENST00000479976 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa42.13■■■■■ 4.33
CHTF18-209ENST00000479976 IFT172Q9UG01 1749 aa42.1■■■■■ 4.33
CHTF18-209ENST00000479976 POTEAQ6S8J7 498 aa42.08■■■■■ 4.33
CHTF18-209ENST00000479976 SHPRHQ149N8 1683 aa42.05■■■■■ 4.32
CHTF18-209ENST00000479976 C1orf167Q5SNV9 1468 aa42.04■■■■■ 4.32
CHTF18-209ENST00000479976 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.03■■■■■ 4.32
CHTF18-209ENST00000479976 PIK3C2GO75747 1445 aa42.01■■■■■ 4.32
CHTF18-209ENST00000479976 LRP6O75581 1613 aa42■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 STK26Q9P289 416 aa42■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.98■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 TECPR2O15040 1411 aa41.95■■■■■ 4.31
CHTF18-209ENST00000479976 ABCC11Q96J66 1382 aa41.94■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 HRCP23327 699 aa41.94■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 ORAI2Q96SN7 254 aa41.94■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.92■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
CHTF18-209ENST00000479976 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms