RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479976.5

CHTF18-209, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 1,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-209	ENST00000479976	BCAN	Q96GW7	911 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CHTF18-209	ENST00000479976	ZFYVE9	O95405	1425 aa		43.2	■■■■■ 4.51
CHTF18-209	ENST00000479976	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	43.19	■■■■■ 4.5
CHTF18-209	ENST00000479976	KCNA6	P17658	529 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CHTF18-209	ENST00000479976	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		43.17	■■■■■ 4.5
CHTF18-209	ENST00000479976	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	43.14	■■■■■ 4.5
CHTF18-209	ENST00000479976	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		43.13	■■■■■ 4.49
CHTF18-209	ENST00000479976	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
CHTF18-209	ENST00000479976	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	43.11	■■■■■ 4.49
CHTF18-209	ENST00000479976	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	43.1	■■■■■ 4.49
CHTF18-209	ENST00000479976	NAIP	Q13075	1403 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CHTF18-209	ENST00000479976	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	43.06	■■■■■ 4.48
CHTF18-209	ENST00000479976	TMEM94	Q12767	1356 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CHTF18-209	ENST00000479976	ILDR2	Q71H61	639 aa		43.04	■■■■■ 4.48
CHTF18-209	ENST00000479976	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.01	■■■■■ 4.48
CHTF18-209	ENST00000479976	TBX22	Q9Y458	520 aa		43	■■■■■ 4.47
CHTF18-209	ENST00000479976	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CHTF18-209	ENST00000479976	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.97	■■■■■ 4.47
CHTF18-209	ENST00000479976	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CHTF18-209	ENST00000479976	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
CHTF18-209	ENST00000479976	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	42.93	■■■■■ 4.46
CHTF18-209	ENST00000479976	HFM1	A2PYH4	1435 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CHTF18-209	ENST00000479976	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.88	■■■■■ 4.46
CHTF18-209	ENST00000479976	TRIM52	Q96A61	297 aa		42.88	■■■■■ 4.45
CHTF18-209	ENST00000479976	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		42.84	■■■■■ 4.45
CHTF18-209	ENST00000479976	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.83	■■■■■ 4.45
CHTF18-209	ENST00000479976	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
CHTF18-209	ENST00000479976	MSH6	P52701	1360 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHTF18-209	ENST00000479976	PIK3R4	Q99570	1358 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CHTF18-209	ENST00000479976	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
CHTF18-209	ENST00000479976	TRPM2	O94759	1503 aa		42.78	■■■■■ 4.44
CHTF18-209	ENST00000479976	CLTCL1	P53675	1640 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CHTF18-209	ENST00000479976	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
CHTF18-209	ENST00000479976	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CHTF18-209	ENST00000479976	SOCS7	O14512	581 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CHTF18-209	ENST00000479976	SLAIN2	Q9P270	581 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CHTF18-209	ENST00000479976	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.69	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	KIF1B	O60333	1816 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CHTF18-209	ENST00000479976	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CHTF18-209	ENST00000479976	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		42.61	■■■■■ 4.41
CHTF18-209	ENST00000479976	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
CHTF18-209	ENST00000479976	MET	P08581	1390 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		42.55	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.53	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	ATF3	P18847	181 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	FOXD1	Q16676	465 aa		42.53	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.52	■■■■■ 4.4
CHTF18-209	ENST00000479976	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		42.5	■■■■■ 4.39
CHTF18-209	ENST00000479976	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
CHTF18-209	ENST00000479976	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CHTF18-209	ENST00000479976	PHLPP1	O60346	1717 aa		42.42	■■■■■ 4.38
CHTF18-209	ENST00000479976	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
CHTF18-209	ENST00000479976	DCC	P43146	1447 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHTF18-209	ENST00000479976	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CHTF18-209	ENST00000479976	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		42.35	■■■■■ 4.37
CHTF18-209	ENST00000479976	PPL	O60437	1756 aa		42.34	■■■■■ 4.37
CHTF18-209	ENST00000479976	JCAD	Q9P266	1359 aa		42.31	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	42.31	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	BRINP3	Q76B58	766 aa		42.29	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.29	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	RGL3	Q3MIN7	710 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		42.25	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	42.24	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	MST1R	Q04912	1400 aa		42.23	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.21	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		42.2	■■■■■ 4.35
CHTF18-209	ENST00000479976	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHTF18-209	ENST00000479976	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CHTF18-209	ENST00000479976	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CHTF18-209	ENST00000479976	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		42.17	■■■■■ 4.34
CHTF18-209	ENST00000479976	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CHTF18-209	ENST00000479976	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		42.13	■■■■■ 4.33
CHTF18-209	ENST00000479976	IFT172	Q9UG01	1749 aa		42.1	■■■■■ 4.33
CHTF18-209	ENST00000479976	POTEA	Q6S8J7	498 aa		42.08	■■■■■ 4.33
CHTF18-209	ENST00000479976	SHPRH	Q149N8	1683 aa		42.05	■■■■■ 4.32
CHTF18-209	ENST00000479976	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		42.04	■■■■■ 4.32
CHTF18-209	ENST00000479976	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		42.03	■■■■■ 4.32
CHTF18-209	ENST00000479976	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.01	■■■■■ 4.32
CHTF18-209	ENST00000479976	LRP6	O75581	1613 aa		42	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	STK26	Q9P289	416 aa		42	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		41.98	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	41.97	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	TECPR2	O15040	1411 aa		41.95	■■■■■ 4.31
CHTF18-209	ENST00000479976	ABCC11	Q96J66	1382 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CHTF18-209	ENST00000479976	HRC	P23327	699 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CHTF18-209	ENST00000479976	ORAI2	Q96SN7	254 aa		41.94	■■■■■ 4.3
CHTF18-209	ENST00000479976	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		41.92	■■■■■ 4.3
CHTF18-209	ENST00000479976	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	41.91	■■■■■ 4.3
CHTF18-209	ENST00000479976	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	41.9	■■■■■ 4.3

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