RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	SOCS7	O14512	581 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTLC1	O15269	473 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJB2	P25686	324 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.48	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	GJA5	P36382	358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.47	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	EYA1	Q99502	592 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10.46	□□□□□ -0.73
RBBP4-208	ENST00000463378	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10.45	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPRE	P23469	700 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.44	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	AP1G2	O75843	785 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	ABL2	P42684	1182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.43	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.42	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	COL9A1	P20849	921 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TATDN2	Q93075	761 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.41	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	LILRB3	O75022	631 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PDE4C	Q08493	712 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	NECTIN2	Q92692	538 aa		10.4	□□□□□ -0.74
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFV2	P19404	249 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	USP46	P62068	366 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	QPCT	Q16769	361 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.39	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	KDM4A	O75164	1064 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	USP17L8	P0C7I0	530 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.38	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	GLMN	Q92990	594 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		10.37	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.36	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.35	□□□□□ -0.75
RBBP4-208	ENST00000463378	FDX1	P10109	184 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	WASHC4	Q2M389	1173 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		10.33	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.32	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXA2	O43364	376 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	GCGR	P47871	477 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.31	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	SMAP	O00193	183 aa		10.3	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	MTMR2	Q13614	643 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RBBP4-208	ENST00000463378	SNPH	O15079	494 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	TSC1	Q92574	1164 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	IRF5	Q13568	498 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	C6orf229	H3BNL8	230 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	RFX1	P22670	979 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC10A3	P09131	477 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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