RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 KCNA6P17658 529 aa36.26■■■■□ 3.4
PPP1CB-208ENST00000455580 BCANQ96GW7 911 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 HFM1A2PYH4 1435 aa36.25■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.24■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.23■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 ALKQ9UM73 1620 aa36.2■■■■□ 3.39
PPP1CB-208ENST00000455580 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPA1LP34931 641 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM52Q96A61 297 aa36.16■■■■□ 3.38
PPP1CB-208ENST00000455580 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.15■■■■□ 3.38
PPP1CB-208ENST00000455580 TBX22Q9Y458 520 aa36.15■■■■□ 3.38
PPP1CB-208ENST00000455580 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.12■■■■□ 3.37
PPP1CB-208ENST00000455580 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM94Q12767 1356 aa36.11■■■■□ 3.37
PPP1CB-208ENST00000455580 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PPP1CB-208ENST00000455580 DISP3Q9P2K9 1392 aa36.09■■■■□ 3.37
PPP1CB-208ENST00000455580 NWD1Q149M9 1564 aa36.06■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa36.05■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 TRPM2O94759 1503 aa36.02■■■■□ 3.36
PPP1CB-208ENST00000455580 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
PPP1CB-208ENST00000455580 CLTCL1P53675 1640 aa35.98■■■■□ 3.35
PPP1CB-208ENST00000455580 PIK3R4Q99570 1358 aa35.97■■■■□ 3.35
PPP1CB-208ENST00000455580 DIP2AQ14689 1571 aa35.96■■■■□ 3.35
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.91■■■■□ 3.34
PPP1CB-208ENST00000455580 MSH6P52701 1360 aa35.89■■■■□ 3.34
PPP1CB-208ENST00000455580 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.88■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF1BO60333 1816 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 FOXD1Q16676 465 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 ILDR2Q71H61 639 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.86■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.85■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRUQ92729 1446 aa35.85■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.85■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.83■■■■□ 3.33
PPP1CB-208ENST00000455580 SLAIN2Q9P270 581 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa35.81■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.8■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 METP08581 1390 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 C14orf37Q86TY3 774 aa35.77■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.76■■■■□ 3.32
PPP1CB-208ENST00000455580 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PPP1CB-208ENST00000455580 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa35.71■■■■□ 3.31
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP1CB-208ENST00000455580 CADPS2Q86UW7 1296 aa35.7■■■■□ 3.31
PPP1CB-208ENST00000455580 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
PPP1CB-208ENST00000455580 ATF3P18847 181 aa35.67■■■■□ 3.3
PPP1CB-208ENST00000455580 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.64■■■■□ 3.3
PPP1CB-208ENST00000455580 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
PPP1CB-208ENST00000455580 RGL3Q3MIN7 710 aa35.62■■■■□ 3.29
PPP1CB-208ENST00000455580 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa35.61■■■■□ 3.29
PPP1CB-208ENST00000455580 PPLO60437 1756 aa35.6■■■■□ 3.29
PPP1CB-208ENST00000455580 DCCP43146 1447 aa35.56■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.56■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 SOCS7O14512 581 aa35.55■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa35.52■■■■□ 3.28
PPP1CB-208ENST00000455580 HRCP23327 699 aa35.5■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 PHLPP1O60346 1717 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 PTCH1Q13635 1447 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.49■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 BRINP3Q76B58 766 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.48■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.47■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 MST1RQ04912 1400 aa35.45■■■■□ 3.27
PPP1CB-208ENST00000455580 JCADQ9P266 1359 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CB-208ENST00000455580 IFT172Q9UG01 1749 aa35.41■■■■□ 3.26
PPP1CB-208ENST00000455580 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PPP1CB-208ENST00000455580 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
PPP1CB-208ENST00000455580 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
PPP1CB-208ENST00000455580 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP1CB-208ENST00000455580 PIK3C2GO75747 1445 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CB-208ENST00000455580 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CB-208ENST00000455580 STK26Q9P289 416 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP1CB-208ENST00000455580 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC11Q96J66 1382 aa35.31■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 TECPR2O15040 1411 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 MYOM2P54296 1465 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.26■■■■□ 3.24
PPP1CB-208ENST00000455580 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.25■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 ORAI2Q96SN7 254 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CB-208ENST00000455580 SIRT1Q96EB6 747 aa35.22■■■■□ 3.23
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