RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441740.6

MEIS3-202, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-202ENST00000441740 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa30.2■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 NLRP1Q9C000 1473 aa30.19■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.15■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.14■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.14■■■□□ 2.42
MEIS3-202ENST00000441740 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.12■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 PTPRMP28827 1452 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 PIK3C2GO75747 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 USP47Q96K76 1375 aa30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 LAMC1P11047 1609 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-202ENST00000441740 CFAP70Q5T0N1 1121 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 ZFYVE9O95405 1425 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.01■■■□□ 2.4
MEIS3-202ENST00000441740 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 IQGAP1P46940 1657 aa29.99■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 HDGFP51858 240 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
MEIS3-202ENST00000441740 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 SLIT1O75093 1534 aa29.93■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 ALKQ9UM73 1620 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 ADGRB1O14514 1584 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.9■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 EID1Q9Y6B2 187 aa29.9■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.89■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 BCANQ96GW7 911 aa29.89■■■□□ 2.38
MEIS3-202ENST00000441740 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.88■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 LTKP29376 864 aa29.88■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
MEIS3-202ENST00000441740 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.82■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.8■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 STK26Q9P289 416 aa29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 CCDC7Q96M83 1385 aa29.77■■■□□ 2.36
MEIS3-202ENST00000441740 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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MEIS3-202ENST00000441740 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.75■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 TESK2Q96S53 571 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.74■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.73■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 METP08581 1390 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
MEIS3-202ENST00000441740 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.68■■■□□ 2.34
MEIS3-202ENST00000441740 TMF1P82094 1093 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS3-202ENST00000441740 DIP2AQ14689 1571 aa29.66■■■□□ 2.34
MEIS3-202ENST00000441740 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
MEIS3-202ENST00000441740 MED14O60244 1454 aa29.65■■■□□ 2.34
MEIS3-202ENST00000441740 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.63■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 PRAM1Q96QH2 718 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 POGKQ9P215 609 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 TBX22Q9Y458 520 aa29.61■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 DLC1Q96QB1 1528 aa29.6■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.6■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 ABCC11Q96J66 1382 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.59■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 HSPA2P54652 639 aa29.58■■■□□ 2.33
MEIS3-202ENST00000441740 LMTK3Q96Q04 1460 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 SLC24A1O60721 1099 aa29.57■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 CPS1P31327 1500 aa29.56■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 PTPRUQ92729 1446 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 TECPR2O15040 1411 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 CDCA8Q53HL2 280 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.54■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.52■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
MEIS3-202ENST00000441740 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.5■■■□□ 2.31
MEIS3-202ENST00000441740 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.49■■■□□ 2.31
MEIS3-202ENST00000441740 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.49■■■□□ 2.31
MEIS3-202ENST00000441740 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-202ENST00000441740 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.48■■■□□ 2.31
MEIS3-202ENST00000441740 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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