RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.52■□□□□ 0.72
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 SCAPERQ9BY12 1400 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 ATP10AO60312 1499 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.5■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 FAM161AQ3B820 660 aa19.49■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 FANCAO15360 1455 aa19.49■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa19.47■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf34Q49A92 452 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 SLC4A3P48751 1232 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.46■□□□□ 0.71
TOP3B-206ENST00000436282 KANK1Q14678 1352 aa19.46■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.44■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRL1O94910 1474 aa19.43■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF521Q96K83 1311 aa19.43■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ASXL2Q76L83 1435 aa19.41■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.41■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ATP7AQ04656 1500 aa19.41■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA2Q08379 1002 aa19.4■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.4■□□□□ 0.7
TOP3B-206ENST00000436282 PPP2R1AP30153 589 aa19.39■□□□□ 0.69
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TOP3B-206ENST00000436282 CHGAP10645 457 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 TRPM2O94759 1503 aa19.37■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRTO14522 1441 aa19.37■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.36■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 CLTCL1P53675 1640 aa19.35■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 SLFN5Q08AF3 891 aa19.35■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 RGS3P49796 1198 aa19.34■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 SYNMO15061 1565 aa19.34■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.34■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 PIK3C2GO75747 1445 aa19.34■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 IQGAP1P46940 1657 aa19.33■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 MADDQ8WXG6 1647 aa19.33■□□□□ 0.69
TOP3B-206ENST00000436282 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 GGT6Q6P531 493 aa19.33■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 OSCARQ8IYS5 282 aa19.33■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 UGGT1Q9NYU2 1555 aa19.32■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa19.32■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa19.32■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 CDCA8Q53HL2 280 aa19.32■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.31■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 STAC3Q96MF2 364 aa19.31■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 TET3O43151 1660 aa19.3■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 DEPDC5O75140 1603 aa19.29■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.27■□□□□ 0.68
TOP3B-206ENST00000436282 CEP152O94986 1710 aa19.27■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 MYOM1P52179 1685 aa19.26■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 CD109Q6YHK3 1445 aa19.25■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 VWDEQ8N2E2 1590 aa19.25■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 USP19O94966 1318 aa19.25■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 E9PSI1 815 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 CCDC146Q8IYE0 955 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 MROH1Q8NDA8 1641 aa19.23■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 BCAR3O75815 825 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 NINLQ9Y2I6 1382 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 RAPGEF3O95398 923 aa19.22■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 APAF1O14727 1248 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 IGHDP01880 384 aa19.21■□□□□ 0.67
TOP3B-206ENST00000436282 PDE3AQ14432 1141 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 NGEFQ8N5V2 710 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.2■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 BECN1Q14457 450 aa19.19■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 NOS1P29475 1434 aa19.19■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa19.19■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM132EQ6IEE7 984 aa19.18■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 NLRP1Q9C000 1473 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 CLUAP1Q96AJ1 413 aa19.17■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 POGZQ7Z3K3 1410 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.16■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.15■□□□□ 0.66
TOP3B-206ENST00000436282 NPATQ14207 1427 aa19.15■□□□□ 0.66
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