RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426156.1

FAM3C-203, Transcript of family with sequence similarity 3 member C, humanhuman

TSL 5

Gene FAM3C, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3C-203ENST00000426156 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 PIP4K2BP78356 416 aa40.93■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.92■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 KCNA6P17658 529 aa40.9■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.89■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 HFM1A2PYH4 1435 aa40.89■■■■■ 4.14
FAM3C-203ENST00000426156 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.84■■■■■ 4.13
FAM3C-203ENST00000426156 TRIM52Q96A61 297 aa40.79■■■■■ 4.12
FAM3C-203ENST00000426156 ALKQ9UM73 1620 aa40.78■■■■■ 4.12
FAM3C-203ENST00000426156 TBX22Q9Y458 520 aa40.77■■■■■ 4.12
FAM3C-203ENST00000426156 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.76■■■■■ 4.12
FAM3C-203ENST00000426156 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
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FAM3C-203ENST00000426156 HSPA1LP34931 641 aa40.75■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 NWD1Q149M9 1564 aa40.73■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 TMEM94Q12767 1356 aa40.73■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
FAM3C-203ENST00000426156 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 TRPM2O94759 1503 aa40.67■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 DIP2AQ14689 1571 aa40.66■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 PIK3R4Q99570 1358 aa40.63■■■■■ 4.1
FAM3C-203ENST00000426156 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.63■■■■■ 4.09
FAM3C-203ENST00000426156 CLTCL1P53675 1640 aa40.6■■■■■ 4.09
FAM3C-203ENST00000426156 KIF1BO60333 1816 aa40.58■■■■■ 4.09
FAM3C-203ENST00000426156 MSH6P52701 1360 aa40.56■■■■■ 4.08
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FAM3C-203ENST00000426156 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
FAM3C-203ENST00000426156 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.53■■■■■ 4.08
FAM3C-203ENST00000426156 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.52■■■■■ 4.08
FAM3C-203ENST00000426156 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.49■■■■■ 4.07
FAM3C-203ENST00000426156 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM3C-203ENST00000426156 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.45■■■■■ 4.07
FAM3C-203ENST00000426156 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.42■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 C14orf37Q86TY3 774 aa40.42■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.42■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.41■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.4■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 SLAIN2Q9P270 581 aa40.39■■■■■ 4.06
FAM3C-203ENST00000426156 PTPRUQ92729 1446 aa40.37■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 SETD5Q9C0A6 1442 aa40.37■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 ILDR2Q71H61 639 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.36■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 FOXD1Q16676 465 aa40.35■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.34■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.32■■■■■ 4.05
FAM3C-203ENST00000426156 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.32■■■■■ 4.04
FAM3C-203ENST00000426156 METP08581 1390 aa40.31■■■■■ 4.04
FAM3C-203ENST00000426156 ATF3P18847 181 aa40.3■■■■■ 4.04
FAM3C-203ENST00000426156 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
FAM3C-203ENST00000426156 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
FAM3C-203ENST00000426156 PPLO60437 1756 aa40.23■■■■■ 4.03
FAM3C-203ENST00000426156 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
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FAM3C-203ENST00000426156 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.17■■■■■ 4.02
FAM3C-203ENST00000426156 SOCS7O14512 581 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM3C-203ENST00000426156 RGL3Q3MIN7 710 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM3C-203ENST00000426156 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.14■■■■■ 4.02
FAM3C-203ENST00000426156 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM3C-203ENST00000426156 PHLPP1O60346 1717 aa40.12■■■■■ 4.01
FAM3C-203ENST00000426156 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
FAM3C-203ENST00000426156 PTCH1Q13635 1447 aa40.08■■■■■ 4.01
FAM3C-203ENST00000426156 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.07■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 HRCP23327 699 aa40.04■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.04■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.04■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 JCADQ9P266 1359 aa40.03■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 IFT172Q9UG01 1749 aa40.02■■■■■ 4
FAM3C-203ENST00000426156 BRINP3Q76B58 766 aa40■■■■□ 3.99
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FAM3C-203ENST00000426156 MST1RQ04912 1400 aa39.98■■■■□ 3.99
FAM3C-203ENST00000426156 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.98■■■■□ 3.99
FAM3C-203ENST00000426156 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.96■■■■□ 3.99
FAM3C-203ENST00000426156 PIK3C2GO75747 1445 aa39.91■■■■□ 3.98
FAM3C-203ENST00000426156 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa39.9■■■■□ 3.98
FAM3C-203ENST00000426156 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa39.87■■■■□ 3.97
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FAM3C-203ENST00000426156 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP39.83■■■■□ 3.97
FAM3C-203ENST00000426156 ABCC11Q96J66 1382 aa39.83■■■■□ 3.97
FAM3C-203ENST00000426156 TECPR2O15040 1411 aa39.82■■■■□ 3.97
FAM3C-203ENST00000426156 STK26Q9P289 416 aa39.82■■■■□ 3.97
FAM3C-203ENST00000426156 MYOM2P54296 1465 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.81■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.8■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.8■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 SHPRHQ149N8 1683 aa39.8■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 NRXN1Q9ULB1 1477 aa39.79■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
FAM3C-203ENST00000426156 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.75■■■■□ 3.95
FAM3C-203ENST00000426156 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
FAM3C-203ENST00000426156 LAMC1P11047 1609 aa39.74■■■■□ 3.95
FAM3C-203ENST00000426156 SIRT1Q96EB6 747 aa39.73■■■■□ 3.95
FAM3C-203ENST00000426156 STAC3Q96MF2 364 aa39.72■■■■□ 3.95
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