RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 NWD1Q149M9 1564 aa27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.35■■□□□ 1.97
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRPM2O94759 1503 aa27.31■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLTCL1P53675 1640 aa27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 SOCS7O14512 581 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 TOM1O60784 492 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNA6P17658 529 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3-202ENST00000373162 DIP2AQ14689 1571 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3-202ENST00000373162 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM94Q12767 1356 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 TBX22Q9Y458 520 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA1LP34931 641 aa27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIK3R4Q99570 1358 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIP4K2BP78356 416 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF1BO60333 1816 aa27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRUQ92729 1446 aa27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIM52Q96A61 297 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCANQ96GW7 911 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPLO60437 1756 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3-202ENST00000373162 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 METP08581 1390 aa26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 MSH6P52701 1360 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 IFT172Q9UG01 1749 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 FOXD1Q16676 465 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 DCCP43146 1447 aa26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLAIN2Q9P270 581 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTCH1Q13635 1447 aa26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHLPP1O60346 1717 aa26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 MST1RQ04912 1400 aa26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.78■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 PIK3C2GO75747 1445 aa26.77■■□□□ 1.88
TRAPPC3-202ENST00000373162 HRCP23327 699 aa26.75■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 TECPR2O15040 1411 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATF3P18847 181 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 C14orf37Q86TY3 774 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYOM2P54296 1465 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.73■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 BRINP3Q76B58 766 aa26.71■■□□□ 1.87
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGL3Q3MIN7 710 aa26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 LAMC1P11047 1609 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHPRHQ149N8 1683 aa26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 JCADQ9P266 1359 aa26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.64■■□□□ 1.86
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCC11Q96J66 1382 aa26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRP6O75581 1613 aa26.62■■□□□ 1.85
TRAPPC3-202ENST00000373162 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-202ENST00000373162 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGRB1O14514 1584 aa26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.54■■□□□ 1.84
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