RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372994.1

C9orf16-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf16, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16-201ENST00000372994 KCNA6P17658 529 aa22.64■■□□□ 1.21
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C9orf16-201ENST00000372994 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.63■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 PIP4K2BP78356 416 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 BCANQ96GW7 911 aa22.61■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 ALKQ9UM73 1620 aa22.6■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 TRIM52Q96A61 297 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 TBX22Q9Y458 520 aa22.58■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
C9orf16-201ENST00000372994 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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C9orf16-201ENST00000372994 NWD1Q149M9 1564 aa22.54■■□□□ 1.2
C9orf16-201ENST00000372994 TMEM94Q12767 1356 aa22.53■■□□□ 1.2
C9orf16-201ENST00000372994 TRPM2O94759 1503 aa22.53■■□□□ 1.2
C9orf16-201ENST00000372994 HSPA1LP34931 641 aa22.53■■□□□ 1.2
C9orf16-201ENST00000372994 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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C9orf16-201ENST00000372994 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
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C9orf16-201ENST00000372994 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.52■■□□□ 1.2
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C9orf16-201ENST00000372994 PIK3R4Q99570 1358 aa22.48■■□□□ 1.19
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C9orf16-201ENST00000372994 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.47■■□□□ 1.19
C9orf16-201ENST00000372994 KIF1BO60333 1816 aa22.46■■□□□ 1.19
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C9orf16-201ENST00000372994 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.42■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.41■■□□□ 1.18
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C9orf16-201ENST00000372994 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.4■■□□□ 1.18
C9orf16-201ENST00000372994 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.39■■□□□ 1.17
C9orf16-201ENST00000372994 PTPRUQ92729 1446 aa22.39■■□□□ 1.17
C9orf16-201ENST00000372994 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.38■■□□□ 1.17
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C9orf16-201ENST00000372994 SLAIN2Q9P270 581 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf16-201ENST00000372994 METP08581 1390 aa22.35■■□□□ 1.17
C9orf16-201ENST00000372994 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.33■■□□□ 1.17
C9orf16-201ENST00000372994 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.32■■□□□ 1.16
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C9orf16-201ENST00000372994 C14orf37Q86TY3 774 aa22.31■■□□□ 1.16
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C9orf16-201ENST00000372994 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.3■■□□□ 1.16
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C9orf16-201ENST00000372994 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
C9orf16-201ENST00000372994 HRCP23327 699 aa22.24■■□□□ 1.15
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C9orf16-201ENST00000372994 DCCP43146 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf16-201ENST00000372994 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf16-201ENST00000372994 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf16-201ENST00000372994 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf16-201ENST00000372994 IFT172Q9UG01 1749 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf16-201ENST00000372994 PTCH1Q13635 1447 aa22.18■■□□□ 1.14
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C9orf16-201ENST00000372994 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.16■■□□□ 1.14
C9orf16-201ENST00000372994 BRINP3Q76B58 766 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf16-201ENST00000372994 MST1RQ04912 1400 aa22.14■■□□□ 1.13
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C9orf16-201ENST00000372994 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf16-201ENST00000372994 PIK3C2GO75747 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf16-201ENST00000372994 JCADQ9P266 1359 aa22.12■■□□□ 1.13
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C9orf16-201ENST00000372994 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf16-201ENST00000372994 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf16-201ENST00000372994 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.02■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 SIRT1Q96EB6 747 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 STAC3Q96MF2 364 aa22■■□□□ 1.11
C9orf16-201ENST00000372994 LAMC1P11047 1609 aa21.99■■□□□ 1.11
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