RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 CHGAP10645 457 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 SLC26A8Q96RN1 970 aa30.57■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 TBX22Q9Y458 520 aa30.55■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 BCANQ96GW7 911 aa30.54■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.53■■■□□ 2.48
PITX3-201ENST00000370002 PIP4K2BP78356 416 aa30.51■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 TRIM52Q96A61 297 aa30.49■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 PIK3R4Q99570 1358 aa30.46■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 TMEM94Q12767 1356 aa30.46■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
PITX3-201ENST00000370002 ALKQ9UM73 1620 aa30.44■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 NWD1Q149M9 1564 aa30.43■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 TRPM2O94759 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 HSPA1LP34931 641 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.42■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 DIP2AQ14689 1571 aa30.41■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.41■■■□□ 2.46
PITX3-201ENST00000370002 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30.38■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.36■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.34■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.33■■■□□ 2.45
PITX3-201ENST00000370002 MSH6P52701 1360 aa30.32■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 CLTCL1P53675 1640 aa30.3■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.29■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30.28■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.27■■■□□ 2.44
PITX3-201ENST00000370002 SETD5Q9C0A6 1442 aa30.26■■■□□ 2.43
PITX3-201ENST00000370002 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PITX3-201ENST00000370002 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.24■■■□□ 2.43
PITX3-201ENST00000370002 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.23■■■□□ 2.43
PITX3-201ENST00000370002 SLAIN2Q9P270 581 aa30.22■■■□□ 2.43
PITX3-201ENST00000370002 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.19■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.19■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 PTPRUQ92729 1446 aa30.19■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.17■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 KIF1BO60333 1816 aa30.17■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 METP08581 1390 aa30.16■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 FOXD1Q16676 465 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 C14orf37Q86TY3 774 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 HRCP23327 699 aa30.15■■■□□ 2.42
PITX3-201ENST00000370002 ATF3P18847 181 aa30.13■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 DCCP43146 1447 aa30.12■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.09■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 ILDR2Q71H61 639 aa30.08■■■□□ 2.41
PITX3-201ENST00000370002 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
PITX3-201ENST00000370002 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.06■■■□□ 2.4
PITX3-201ENST00000370002 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
PITX3-201ENST00000370002 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.05■■■□□ 2.4
PITX3-201ENST00000370002 PTCH1Q13635 1447 aa30.02■■■□□ 2.4
PITX3-201ENST00000370002 RGL3Q3MIN7 710 aa30.01■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.98■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.96■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 SOCS7O14512 581 aa29.96■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 PPLO60437 1756 aa29.96■■■□□ 2.39
PITX3-201ENST00000370002 JCADQ9P266 1359 aa29.93■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 BRINP3Q76B58 766 aa29.92■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.91■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 MST1RQ04912 1400 aa29.9■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 PIK3C2GO75747 1445 aa29.89■■■□□ 2.38
PITX3-201ENST00000370002 STAC3Q96MF2 364 aa29.88■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 ABCC11Q96J66 1382 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 TECPR2O15040 1411 aa29.86■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.85■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 SIRT1Q96EB6 747 aa29.84■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 MYOM2P54296 1465 aa29.83■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.83■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 PHLPP1O60346 1717 aa29.83■■■□□ 2.37
PITX3-201ENST00000370002 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 IFT172Q9UG01 1749 aa29.81■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.8■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.79■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
PITX3-201ENST00000370002 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.75■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.75■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 STK26Q9P289 416 aa29.74■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.71■■■□□ 2.35
PITX3-201ENST00000370002 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.69■■■□□ 2.34
PITX3-201ENST00000370002 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.68■■■□□ 2.34
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