RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 EYA1Q99502 592 aa9.9□□□□□ -0.82
CCL20-201ENST00000358813 IRF6O14896 467 aa9.89□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 WNT2BQ93097 391 aa9.88□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 MMRN1Q13201 1228 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 ZMYND15Q9H091 742 aa9.87□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 SCRIBQ14160 1630 aa9.86□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 RCCD1A6NED2 376 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 DNAJB2P25686 324 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 CCDC102AQ96A19 550 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.85□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 LRCH3Q96II8 777 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.84□□□□□ -0.83
CCL20-201ENST00000358813 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.83□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 BCAMP50895 628 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 IL27Q8NEV9 243 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 PHOX2BQ99453 314 aa9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 RNF40O75150 1001 aa9.8□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 SLC4A3P48751 1232 aa9.8□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 NLRP7Q8WX94 980 aa9.8□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.8□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 PTPN5P54829 565 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 SLF2Q8IX21 1173 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL20-201ENST00000358813 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 PPP4CP60510 307 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 HCSTQ9UBK5 93 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 TRIM66O15016 1216 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 PDE4DQ08499 809 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 WBP1LQ9NX94 342 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 CLCN1P35523 988 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 AMHR2Q16671 573 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 NECTIN2Q92692 538 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 ERCC6Q03468 1493 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-201ENST00000358813 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 SULF1Q8IWU6 871 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 RDH13Q8NBN7 331 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 SLC10A3P09131 477 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 CUX2O14529 1486 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 CFHP08603 1231 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.65□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 PRR14Q9BWN1 585 aa9.65□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CCL20-201ENST00000358813 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 APLP1P51693 650 aa9.64□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 FLIIQ13045 1269 aa9.64□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.64□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 ARID3AQ99856 593 aa9.64□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 CD46P15529 392 aa9.62□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 FAM117AQ9C073 453 aa9.62□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 GCGRP47871 477 aa9.61□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa9.59□□□□□ -0.87
CCL20-201ENST00000358813 MS4A1P11836 297 aa9.58□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.57□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 PLEKHG3A1L390 1219 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 APBB1O00213 710 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 KDM4AO75164 1064 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 HRCP23327 699 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 COPS2P61201 443 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 FUT2Q10981 343 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.56□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 MTRQ99707 1265 aa9.55□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 ATP6V1AP38606 617 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 GOPCQ9HD26 462 aa9.54□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.53□□□□□ -0.88
CCL20-201ENST00000358813 IL21Q9HBE4 155 aa9.53□□□□□ -0.88
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