RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347077.8

ZNF546-201, Transcript of zinc finger protein 546, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF546, Length 7,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546-201ENST00000347077 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.33□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 WIZO95785 1651 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 PSMA5P28066 241 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 NEUROD2Q15784 382 aa7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 RUFY1Q96T51 708 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CLSTN1O94985 981 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 USP8P40818 1118 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.31□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 MARCH6O60337 910 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 PDCL2Q8N4E4 241 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 JMYQ8N9B5 988 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 RABEP1Q15276 862 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 IQCEQ6IPM2 695 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 HECW1Q76N89 1606 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 G3V3G9 751 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 AKNAQ7Z591 1439 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ERICH2A1L162 156 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 GSE1Q14687 1217 aa7.3□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD1Q15327 319 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CUL7Q14999 1698 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 ERLIN2O94905 339 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 AMPHP49418 695 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 GNAI1P63096 354 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 SMARCE1Q969G3 411 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 COG3Q96JB2 828 aa7.29□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DACH1Q9UI36 760 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 SART3Q15020 963 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 MRE11P49959 708 aa7.27□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.27□□□□□ -1.24
ZNF546-201ENST00000347077 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TXLNAP40222 546 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 CPLX1O14810 134 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 OLFM4Q6UX06 510 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 USP47Q96K76 1375 aa7.27□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 MCM3P25205 808 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TEFQ10587 303 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 DESP17661 470 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 FOXD1Q16676 465 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 INCENPQ9NQS7 918 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 FILIP1LQ4L180 1135 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 GNAI3P08754 354 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 FEZ1Q99689 392 aa7.26□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 RUNDC1Q96C34 613 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 FAM107BQ9H098 131 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 CAVIN2O95810 425 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 RRP1P56182 461 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TUBB4BP68371 445 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 PDE3AQ14432 1141 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 MAP3K1Q13233 1512 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 ODF2Q5BJF6 829 aa7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ZNF546-201ENST00000347077 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms