RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 PLCH2O75038 1416 aa22.66■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 SYNMO15061 1565 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.65■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.64■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 AFAP1Q8N556 730 aa22.64■■□□□ 1.22
PDE4A-201ENST00000293683 SLFN5Q08AF3 891 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 IL27Q8NEV9 243 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 MYOM1P52179 1685 aa22.64■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 ABCC1P33527 1531 aa22.63■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 SHROOM2Q13796 1616 aa22.63■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 CLTCL1P53675 1640 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 APAF1O14727 1248 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 TRPM2O94759 1503 aa22.62■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 RGS3P49796 1198 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 C8orf34Q49A92 452 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 USP35Q9P2H5 1018 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 PIK3C2GO75747 1445 aa22.61■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 BCAR3O75815 825 aa22.6■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 CDCA8Q53HL2 280 aa22.6■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.6■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 CEP152O94986 1710 aa22.58■■□□□ 1.21
PDE4A-201ENST00000293683 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.58■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 FAM161AQ3B820 660 aa22.57■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRTO14522 1441 aa22.56■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.55■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.54■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 NFKBIBQ15653 356 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.53■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.52■■□□□ 1.2
PDE4A-201ENST00000293683 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.52■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 ERVK-7P63135 1459 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.5■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 IGHDP01880 384 aa22.48■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 KIF3BO15066 747 aa22.47■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 DEPDC5O75140 1603 aa22.47■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 E9PSI1 815 aa22.47■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 TET3O43151 1660 aa22.47■■□□□ 1.19
PDE4A-201ENST00000293683 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 ABCA6Q8N139 1617 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 STAC3Q96MF2 364 aa22.45■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 PANK1Q8TE04 598 aa22.44■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 GSE1Q14687 1217 aa22.43■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 NEUROD2Q15784 382 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 COG6Q9Y2V7 657 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 KANK1Q14678 1352 aa22.42■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 WWC1Q8IX03 1113 aa22.41■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 ATP7AQ04656 1500 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.4■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PDE4A-201ENST00000293683 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.38■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 SEC24BO95487 1268 aa22.38■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 USP19O94966 1318 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.37■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 MYOM2P54296 1465 aa22.36■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.36■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 TNNQ9UQP3 1299 aa22.36■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.35■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 FANCAO15360 1455 aa22.35■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 MROH2AA6NES4 1674 aa22.35■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.35■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 PDE3AQ14432 1141 aa22.34■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.33■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.33■■□□□ 1.17
PDE4A-201ENST00000293683 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.33■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.32■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 MORC1Q86VD1 984 aa22.32■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 SHPRHQ149N8 1683 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 NOS1P29475 1434 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 RLBP1P12271 317 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 KIF1BO60333 1816 aa22.31■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 IFT172Q9UG01 1749 aa22.3■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PDE4A-201ENST00000293683 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.29■■□□□ 1.16
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