RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 AAMPQ13685 434 aa21.85■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.85■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.85■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 PPP2R1AP30153 589 aa21.84■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.83■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.82■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.82■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 KIF16BQ96L93 1317 aa21.81■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 DAPK1P53355 1430 aa21.81■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 MTHFSP49914 203 aa21.8■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.8■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC184Q52MB2 194 aa21.8■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 PANK1Q8TE04 598 aa21.8■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 IFT140Q96RY7 1462 aa21.79■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.79■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 GORABQ5T7V8 394 aa21.79■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.79■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.78■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.78■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 HECW1Q76N89 1606 aa21.78■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 GNAI1P63096 354 aa21.77■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 RILPL2Q969X0 211 aa21.77■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.77■■□□□ 1.08
SCARB2-201ENST00000264896 CABP2Q9NPB3 220 aa21.76■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.76■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 ROCK1Q13464 1354 aa21.75■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 REC8O95072 547 aa21.74■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 TEFQ10587 303 aa21.74■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 AKNAQ7Z591 1439 aa21.74■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.74■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 MAP3K1Q13233 1512 aa21.73■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.73■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 LNPKQ9C0E8 428 aa21.72■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.72■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 HMOX1P09601 288 aa21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 PHF14O94880 888 aa21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SCARB2-201ENST00000264896 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 PDE3AQ14432 1141 aa21.7■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.68■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.68■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.68■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.68■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.67■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.67■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.66■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.66■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 KIF3AQ9Y496 699 aa21.66■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 NFKBIBQ15653 356 aa21.65■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.65■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.65■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 ERBINQ96RT1 1412 aa21.64■■□□□ 1.06
SCARB2-201ENST00000264896 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.63■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.62■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.62■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 NECTIN2Q92692 538 aa21.61■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.61■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 BCAR3O75815 825 aa21.61■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 BACH2Q9BYV9 841 aa21.6■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 TPM4P67936 248 aa21.59■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.59■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.59■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 PRKAR2BP31323 418 aa21.59■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.58■■□□□ 1.05
SCARB2-201ENST00000264896 IQGAP2Q13576 1575 aa21.58■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 ABCC5O15440 1437 aa21.57■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.57■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 PRAM1Q96QH2 718 aa21.57■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 NUCB2P80303 420 aa21.56■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 WDR63Q8IWG1 891 aa21.56■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 CDC45O75419 566 aa21.55■■□□□ 1.04
SCARB2-201ENST00000264896 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.55■■□□□ 1.04
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