RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.94■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.94■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 PDE3BQ13370 1112 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 ATP7AQ04656 1500 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.93■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 SLC4A3P48751 1232 aa23.92■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.91■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 APAF1O14727 1248 aa23.91■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.9■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 CLTCL1P53675 1640 aa23.89■■□□□ 1.42
PANX1-201ENST00000227638 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 NEUROD2Q15784 382 aa23.89■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.88■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 BACH2Q9BYV9 841 aa23.88■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.88■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 KANK1Q14678 1352 aa23.87■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 BCAR3O75815 825 aa23.86■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 OSCARQ8IYS5 282 aa23.86■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 GGT6Q6P531 493 aa23.86■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 TRPM2O94759 1503 aa23.85■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.85■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.85■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.85■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 MADDQ8WXG6 1647 aa23.84■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.84■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 RGS3P49796 1198 aa23.83■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.83■■□□□ 1.41
PANX1-201ENST00000227638 PTPRTO14522 1441 aa23.82■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA2Q08379 1002 aa23.82■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 DEPDC5O75140 1603 aa23.8■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 LAMC1P11047 1609 aa23.8■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 CEP152O94986 1710 aa23.78■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 TET3O43151 1660 aa23.78■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 RAPGEF3O95398 923 aa23.78■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.77■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.77■■□□□ 1.4
PANX1-201ENST00000227638 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.76■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.76■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 SLFN5Q08AF3 891 aa23.75■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 ZNF521Q96K83 1311 aa23.75■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 CD109Q6YHK3 1445 aa23.74■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.72■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.71■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 IQGAP1P46940 1657 aa23.71■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 TNNQ9UQP3 1299 aa23.71■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 NEFMP07197 916 aa23.7■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 CDCA8Q53HL2 280 aa23.7■■□□□ 1.39
PANX1-201ENST00000227638 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.69■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 PANK1Q8TE04 598 aa23.69■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.69■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.69■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 ERVK-7P63135 1459 aa23.66■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 IGHDP01880 384 aa23.66■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 NOS1P29475 1434 aa23.65■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 MS4A1P11836 297 aa23.65■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.65■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 MROH2AA6NES4 1674 aa23.65■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 COG6Q9Y2V7 657 aa23.65■■□□□ 1.38
PANX1-201ENST00000227638 ABCA6Q8N139 1617 aa23.63■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 NPATQ14207 1427 aa23.62■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.62■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 MORC1Q86VD1 984 aa23.62■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.61■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 KIF1BO60333 1816 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 STK26Q9P289 416 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 C8orf34Q49A92 452 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 MYOM1P52179 1685 aa23.6■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.59■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 WWC1Q8IX03 1113 aa23.59■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.58■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 STAC3Q96MF2 364 aa23.58■■□□□ 1.37
PANX1-201ENST00000227638 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.58■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 CABP2Q9NPB3 220 aa23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 SYNMO15061 1565 aa23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 PIK3C2GO75747 1445 aa23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 MTHFSP49914 203 aa23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.55■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 SEC24BO95487 1268 aa23.53■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 E9PSI1 815 aa23.53■■□□□ 1.36
PANX1-201ENST00000227638 RLBP1P12271 317 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms