RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000086933.2

GSC2-201, Transcript of goosecoid homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GSC2, Length 1,033 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2-201ENST00000086933 ALKQ9UM73 1620 aa40.78■■■■■ 4.12
GSC2-201ENST00000086933 NWD1Q149M9 1564 aa40.78■■■■■ 4.12
GSC2-201ENST00000086933 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.78■■■■■ 4.12
GSC2-201ENST00000086933 CLTCL1P53675 1640 aa40.78■■■■■ 4.12
GSC2-201ENST00000086933 KCNA6P17658 529 aa40.73■■■■■ 4.11
GSC2-201ENST00000086933 TRIM52Q96A61 297 aa40.72■■■■■ 4.11
GSC2-201ENST00000086933 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.72■■■■■ 4.11
GSC2-201ENST00000086933 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.71■■■■■ 4.11
GSC2-201ENST00000086933 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
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GSC2-201ENST00000086933 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
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GSC2-201ENST00000086933 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
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GSC2-201ENST00000086933 TBX22Q9Y458 520 aa40.68■■■■■ 4.1
GSC2-201ENST00000086933 TOM1O60784 492 aa40.67■■■■■ 4.1
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GSC2-201ENST00000086933 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.61■■■■■ 4.09
GSC2-201ENST00000086933 KIF1BO60333 1816 aa40.6■■■■■ 4.09
GSC2-201ENST00000086933 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.59■■■■■ 4.09
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GSC2-201ENST00000086933 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
GSC2-201ENST00000086933 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.54■■■■■ 4.08
GSC2-201ENST00000086933 BCANQ96GW7 911 aa40.52■■■■■ 4.08
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GSC2-201ENST00000086933 FOXD1Q16676 465 aa40.44■■■■■ 4.06
GSC2-201ENST00000086933 PIP4K2BP78356 416 aa40.43■■■■■ 4.06
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GSC2-201ENST00000086933 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.41■■■■■ 4.06
GSC2-201ENST00000086933 HRCP23327 699 aa40.4■■■■■ 4.06
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GSC2-201ENST00000086933 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.4■■■■■ 4.06
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GSC2-201ENST00000086933 PPLO60437 1756 aa40.37■■■■■ 4.05
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GSC2-201ENST00000086933 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
GSC2-201ENST00000086933 METP08581 1390 aa40.33■■■■■ 4.05
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GSC2-201ENST00000086933 MSH6P52701 1360 aa40.3■■■■■ 4.04
GSC2-201ENST00000086933 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.28■■■■■ 4.04
GSC2-201ENST00000086933 IFT172Q9UG01 1749 aa40.25■■■■■ 4.03
GSC2-201ENST00000086933 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.21■■■■■ 4.03
GSC2-201ENST00000086933 DCCP43146 1447 aa40.17■■■■■ 4.02
GSC2-201ENST00000086933 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.17■■■■■ 4.02
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GSC2-201ENST00000086933 ATF3P18847 181 aa39.98■■■■□ 3.99
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GSC2-201ENST00000086933 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.9■■■■□ 3.98
GSC2-201ENST00000086933 LAMC1P11047 1609 aa39.89■■■■□ 3.98
GSC2-201ENST00000086933 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
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GSC2-201ENST00000086933 STAC3Q96MF2 364 aa39.82■■■■□ 3.97
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GSC2-201ENST00000086933 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.78■■■■□ 3.96
GSC2-201ENST00000086933 SIRT1Q96EB6 747 aa39.78■■■■□ 3.96
GSC2-201ENST00000086933 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.76■■■■□ 3.96
GSC2-201ENST00000086933 NHSL1Q5SYE7 1610 aa39.76■■■■□ 3.95
GSC2-201ENST00000086933 JCADQ9P266 1359 aa39.75■■■■□ 3.95
GSC2-201ENST00000086933 TMEM132EQ6IEE7 984 aa39.75■■■■□ 3.95
GSC2-201ENST00000086933 ADGRB1O14514 1584 aa39.74■■■■□ 3.95
GSC2-201ENST00000086933 CFAP70Q5T0N1 1121 aa39.73■■■■□ 3.95
GSC2-201ENST00000086933 DLC1Q96QB1 1528 aa39.68■■■■□ 3.94
GSC2-201ENST00000086933 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.67■■■■□ 3.94
GSC2-201ENST00000086933 STK26Q9P289 416 aa39.66■■■■□ 3.94
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