RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000140754.1

Gm2018-201, mousemouse

TSL 2 BASIC

Gene Gm2018, Length 478 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Psme1P97371 249 aa37.26■■■■□ 3.56
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Slain2Q8CI08 581 aa37.24■■■■□ 3.55
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa37.24■■■■□ 3.55
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Adgrl1Q80TR1 1466 aa37.23■■■■□ 3.55
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa37.22■■■■□ 3.55
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa37.18■■■■□ 3.54
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Arap3Q8R5G7 1538 aa37.17■■■■□ 3.54
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa37.16■■■■□ 3.54
Gm2018-201ENSMUST00000140754 MypopQ8R4U1 393 aa37.15■■■■□ 3.54
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Dmrt2Q8BG36 561 aa37.14■■■■□ 3.54
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Asxl2Q8BZ32 1370 aa37.13■■■■□ 3.53
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tns3Q5SSZ5 1440 aa37.11■■■■□ 3.53
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa37.1■■■■□ 3.53
Gm2018-201ENSMUST00000140754 AnkarA2RT91 1465 aa37.09■■■■□ 3.53
Gm2018-201ENSMUST00000140754 PalldQ9ET54 1408 aa37.07■■■■□ 3.52
Gm2018-201ENSMUST00000140754 PtprvP70289 1705 aa37.07■■■■□ 3.52
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Lrp6O88572 1613 aa37.05■■■■□ 3.52
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ino80Q6ZPV2 1559 aa37.04■■■■□ 3.52
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Rgs17Q9QZB0 210 aa37.01■■■■□ 3.52
Gm2018-201ENSMUST00000140754 MpndQ3TV65 487 aa36.99■■■■□ 3.51
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Znf526Q8BI66 675 aa36.98■■■■□ 3.51
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Efcab6Q6P1E8 1516 aa36.98■■■■□ 3.51
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.51
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Siglec1Q62230 1695 aa36.93■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ggt6Q6PDE7 497 aa36.93■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa36.93■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 PplQ9R269 1755 aa36.92■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Erich6D3Z6S9 713 aa36.91■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Atp7aQ64430 1491 aa36.9■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Map4P27546 1125 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Atf3Q60765 181 aa36.86■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Stk24Q99KH8 431 aa36.85■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Myom3A2ABU4 1439 aa36.83■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Nwd1A6H603 1563 aa36.83■■■■□ 3.49
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Slit3Q9WVB4 1523 aa36.82■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Uggt1Q6P5E4 1551 aa36.81■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Zfp644E9QA22 1323 aa36.8■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tmem94Q7TSH8 1360 aa36.79■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tecpr2Q3UH45 1423 aa36.78■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Zfp142G5E869 1843 aa36.75■■■■□ 3.47
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Arhgef28P97433 1693 aa36.71■■■■□ 3.47
Gm2018-201ENSMUST00000140754 NclP09405 707 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Clstn2Q9ER65 966 aa36.69■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Iqgap3F8VQ29 1632 aa36.68■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Dapk1Q80YE7 1442 aa36.68■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Nsd2Q8BVE8 1365 aa36.66■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 KdrP35918 1367 aa36.64■■■■□ 3.46
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Sall3Q62255 1320 aa36.63■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tarbp1E9Q368 1579 aa36.63■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Mroh1E0CZ22 1640 aa36.61■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Kif24Q6NWW5 1356 aa36.6■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Atp1b4Q99ME6 356 aa36.59■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa36.59■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Abcc10Q8R4P9 1501 aa36.58■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Cd109Q8R422 1442 aa36.58■■■■□ 3.45
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa36.56■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 C3P01027 1663 aa36.55■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Q9D9H8 365 aa36.54■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Col14a1Q80X19 1797 aa36.53■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 PtprgQ05909 1442 aa36.52■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ttll5Q8CHB8 1328 aa36.52■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Smim5Q8BT42 78 aa36.51■■■■□ 3.44
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP36.5■■■■□ 3.43
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Pik3r4Q8VD65 1358 aa36.44■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 UacaQ8CGB3 1411 aa36.43■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 NalcnQ8BXR5 1738 aa36.43■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Eno4Q8C042 619 aa36.42■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 AatkQ80YE4 1365 aa36.41■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 AU022751B1B0V2 589 aa36.4■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 GnpatP98192 678 aa36.4■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Emilin2Q8K482 1074 aa36.4■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 ErbinQ80TH2 1402 aa36.4■■■■□ 3.42
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Rfx7F8VPJ6 1459 aa36.37■■■■□ 3.41
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Shq1Q7TMX5 569 aa36.35■■■■□ 3.41
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Pik3c2gO70167 1506 aa36.34■■■■□ 3.41
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Trak1Q6PD31 939 aa36.34■■■■□ 3.41
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Abca8aQ8K442 1620 aa36.34■■■■□ 3.41
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Col22a1E9Q7P1 1613 aa36.32■■■■□ 3.4
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa36.28■■■■□ 3.4
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Tex14Q7M6U3 1450 aa36.27■■■■□ 3.4
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP36.25■■■■□ 3.39
Gm2018-201ENSMUST00000140754 DccP70211 1447 aa36.23■■■■□ 3.39
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Gm10563F6WIE4 79 aa36.22■■■■□ 3.39
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ift172Q6VH22 1749 aa36.2■■■■□ 3.39
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Robo1O89026 1612 aa36.18■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Ccdc6D3YZP9 469 aa36.17■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Rreb1Q3UH06 1700 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Farp2Q91VS8 1065 aa36.16■■■■□ 3.38
Gm2018-201ENSMUST00000140754 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.4 ms