RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000116412.7

Ctu2-201, Transcript of Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctu2, Length 3,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa18.58■□□□□ 0.57
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cfap74Q3UY96 1578 aa18.58■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Lemd3Q9WU40 921 aa18.56■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 CanxP35564 591 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Chmp5Q9D7S9 219 aa18.55■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Adamts13Q769J6 1426 aa18.55■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mast1Q9R1L5 1570 aa18.54■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Polr3glQ8R0C0 218 aa18.53■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 PrkcshO08795 521 aa18.53■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rnf17Q99MV7 1640 aa18.53■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Golga2Q921M4 999 aa18.53■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Tex14Q7M6U3 1450 aa18.52■□□□□ 0.56
Ctu2-201ENSMUST00000116412 DaxxO35613 739 aa18.52■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 ErbinQ80TH2 1402 aa18.52■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc30Q8BVF4 654 aa18.51■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Sbno1Q689Z5 1390 aa18.51■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mink1Q9JM52 1308 aa18.51■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Tulp4Q9JIL5 1547 aa18.5■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa18.5■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Plekhh1Q80TI1 1356 aa18.5■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 EspnQ9ET47 871 aa18.5■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Setd1aE9PYH6 1716 aa18.49■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Plch2A2AP18 1501 aa18.49■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abcc1O35379 1528 aa18.49■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abcc6Q9R1S7 1498 aa18.49■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 4933416C03RikQ3V063 378 aa18.49■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Hsp90aa1P07901 733 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ttc21bQ0HA38 1315 aa18.48■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Stag3O70576 1240 aa18.47■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Znf608Q56A10 1511 aa18.47■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cep170Q6A065 1588 aa18.46■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abcc3B2RX12 1523 aa18.46■□□□□ 0.55
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Trim30dE9PWL0 497 aa18.46■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Trim26Q99PN3 545 aa18.46■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Stard8Q8K031 1019 aa18.45■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Neurl4Q5NCX5 1563 aa18.44■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa18.44■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Amer1Q7TS75 1132 aa18.43■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 TnikP83510 1323 aa18.43■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Iqcf3Q9D498 203 aa18.43■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa18.43■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 ArxO35085 564 aa18.42■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Atp1b4Q99ME6 356 aa18.42■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Atf7ipQ7TT18 1306 aa18.41■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Robo2Q7TPD3 1470 aa18.41■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Igf1rQ60751 1373 aa18.4■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NhsB1AV60 1647 aa18.39■□□□□ 0.54
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Armcx1Q9CX83 456 aa18.39■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa18.39■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Tspyl2Q7TQI8 677 aa18.38■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 NudcO35685 332 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Pank1Q8K4K6 548 aa18.38■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ak9G3UYQ4 1894 aa18.38■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Hecw1Q8K4P8 1604 aa18.38■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Dnai1Q8C0M8 701 aa18.37■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa18.37■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ralbp1Q62172 648 aa18.37■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 IqubQ8CDK3 788 aa18.36■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 ShprhQ7TPQ3 1674 aa18.36■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Gas2l2Q5SSG4 860 aa18.35■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa18.35■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 GsdmaQ9EST1 446 aa18.34■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Stk26Q99JT2 416 aa18.34■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ttc41Q692V3 1318 aa18.33■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Abca8bQ8K440 1620 aa18.33■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ppm1gQ61074 542 aa18.33■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Atxn3Q9CVD2 355 aa18.33■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Usp19Q3UJD6 1360 aa18.33■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 AatkQ80YE4 1365 aa18.32■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Col17a1Q07563 1470 aa18.31■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Uspl1Q3ULM6 1089 aa18.31■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Apaf1O88879 1249 aa18.3■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ksr2Q3UVC0 959 aa18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 AnkarA2RT91 1465 aa18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Nkx1-2P42580 305 aa18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Pola1P33609 1465 aa18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ak7Q9D2H2 614 aa18.29■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ecm2Q5FW85 670 aa18.28■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kidins220E9Q9B7 1793 aa18.28■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa18.28■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa18.27■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Ipo8Q7TMY7 1010 aa18.27■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Tsen2Q6P7W5 460 aa18.27■□□□□ 0.52
Ctu2-201ENSMUST00000116412 Myo3aQ8K3H5 1613 aa18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.3 ms