RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020043.11

Lrriq1-201, Transcript of Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrriq1, Length 2,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Tarbp1E9Q368 1579 aa8.71□□□□□ -1.01
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa8.71□□□□□ -1.01
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rapgef3Q8VCC8 918 aa8.71□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Efcab6Q6P1E8 1516 aa8.71□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Trak1Q6PD31 939 aa8.7□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Atp7aQ64430 1491 aa8.7□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa8.7□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa8.7□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Uggt1Q6P5E4 1551 aa8.69□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 PzpQ61838 1495 aa8.69□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 IghaA0A0A6YXW6 389 aa8.69□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Kif21bQ9QXL1 1668 aa8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Abca8aQ8K442 1620 aa8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Cdca7Q9D0M2 382 aa8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Setd1aE9PYH6 1716 aa8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Erich6D3Z6S9 713 aa8.68□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Med1Q925J9 1575 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Sall3Q62255 1320 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Pik3c2gO70167 1506 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Mroh1E0CZ22 1640 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Myo3aQ8K3H5 1613 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 PplQ9R269 1755 aa8.67□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Txndc2Q6P902 515 aa8.66□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Stk24Q99KH8 431 aa8.66□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Mphosph9A6H5Y1 991 aa8.65□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Thsd7aQ69ZU6 1645 aa8.65□□□□□ -1.02
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Hspa1lP16627 641 aa8.64□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 AatkQ80YE4 1365 aa8.64□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa8.64□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ecm2Q5FW85 670 aa8.63□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 ErbinQ80TH2 1402 aa8.63□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Iqsec2Q5DU25 1478 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Psme1P97371 249 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Amigo3Q8C2S7 508 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Asxl2Q8BZ32 1370 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 P3h3Q8CG70 732 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Slit3Q9WVB4 1523 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 PalldQ9ET54 1408 aa8.62□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 AU022751B1B0V2 589 aa8.61□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Dot1lQ6XZL8 1540 aa8.61□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Arhgef28P97433 1693 aa8.6□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Col18a1P39061 1774 aa8.6□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Pkd2O35245 966 aa8.59□□□□□ -1.03
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Gm13695A2AK44 830 aa8.58□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Mbd5B1AYB6 1498 aa8.57□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Pcgf6Q99NA9 353 aa8.57□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa8.56□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa8.56□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Bcl11bQ99PV8 884 aa8.55□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Washc2Q6PGL7 1334 aa8.55□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Arap3Q8R5G7 1538 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Hs6st3Q9QYK4 470 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Tns3Q5SSZ5 1440 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ccer2J3QPU5 274 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Q9D9H8 365 aa8.54□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 MaddQ80U28 1577 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Adamts13Q769J6 1426 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rims1Q99NE5 1463 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Brinp3Q499E0 766 aa8.53□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Mier1Q5UAK0 511 aa8.52□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Shq1Q7TMX5 569 aa8.52□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Atp1b4Q99ME6 356 aa8.52□□□□□ -1.04
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 DnmbpQ6TXD4 1580 aa8.52□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Tulp4Q9JIL5 1547 aa8.52□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Slain2Q8CI08 581 aa8.52□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Pik3r4Q8VD65 1358 aa8.52□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Ift172Q6VH22 1749 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Arid3aQ62431 601 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Chrna2Q91X60 512 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rock1P70335 1354 aa8.51□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Evi5lH3BKQ3 813 aa8.5□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa8.5□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Cps1Q8C196 1500 aa8.49□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Col14a1Q80X19 1797 aa8.49□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 NalcnQ8BXR5 1738 aa8.49□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Nwd1A6H603 1563 aa8.49□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Tmem94Q7TSH8 1360 aa8.48□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Pik3c2aQ61194 1686 aa8.48□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa8.48□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Usp47Q8BY87 1376 aa8.47□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Eid3Q3V124 375 aa8.47□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa8.47□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Akt1s1Q9D1F4 257 aa8.47□□□□□ -1.05
Lrriq1-201ENSMUST00000020043 Rgl3Q3UYI5 709 aa8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.5 ms