RNA–Protein interactions for RNA: YGL009C

LEU1, Transcript of Isopropylmalate isomerase, yeast

Gene LEU1, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LEU1	YGL009C	BI2	P03873	423 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	SNC1	P31109	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	AVT6	P40074	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	YNR048W	P53740	393 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	PET191	Q02772	108 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	TDA1	Q03533	586 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	YDL218W	Q07629	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	PEX11	Q12462	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	SPT14	P32363	452 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	YJL043W	P47053	257 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	SUE1	Q06524	206 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	MYO1	P08964	1928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LEU1	YGL009C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SCM4	P32564	187 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SEC17	P32602	292 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	RCN1	P36054	211 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	DOG2	P38773	246 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	AYR1	P40471	297 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YIL029C	P40538	142 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YJR012C	P47087	207 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ASI3	P53983	676 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	HHT1	P61830	136 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MAK3	Q03503	176 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	RAV2	Q03956	351 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SFH1	Q06168	426 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	IGO2	Q9P305	131 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YCR007C	P25354	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YMC1	P32331	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YOR062C	P36025	268 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
LEU1	YGL009C	OMA1	P36163	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YHL026C	P38740	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	DIE2	P50076	525 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	CNL1	Q06333	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MDM10	P18409	493 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MKK1	P32490	508 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	DOG1	P38774	246 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MDM31	P38880	579 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MST27	P53176	234 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	LST7	P53237	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	HST4	P53688	370 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MRX11	Q03079	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MHT1	Q12525	324 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	HKR1	P41809	1802 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	RNP1	P32385	249 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SNC2	P33328	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	COS10	P52924	374 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	DOC1	P53068	250 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SLM2	P53955	656 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	NUP100	Q02629	959 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YLR030W	Q07967	263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ATP14	Q12349	124 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	OCA6	Q12454	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ACB1	P31787	87 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ZRT1	P32804	376 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ETR1	P38071	380 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	XBP1	P40489	647 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	LCB3	P47013	409 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	PCP1	P53259	346 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YGR219W	P53307	113 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	ORT1	Q12375	292 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	FLO1	P32768	1537 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	SFC1	P33303	322 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MRPL3	P36516	390 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YPC1	P38298	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	HMS2	P47175	358 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	FMP48	P53233	369 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	GOT1	Q03554	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	BSP1	Q06604	576 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	COQ10	Q08058	207 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	PEX34	P25584	144 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LEU1	YGL009C	MOB2	P43563	287 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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