RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W ADH3P07246 375 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W TRX3P25372 127 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W LDB16P25587 256 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YKR041WP36134 250 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W FIG1P38224 298 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W MIG2P53035 382 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W HST4P53688 370 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W NUP49Q02199 472 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YOL160WQ08321 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W TDA8Q6B2U8 126 aa2.3□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YPR170W-BP0C5R9 85 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W CNB1P25296 175 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W ATG22P25568 528 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W MEI4P29467 408 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W ARO7P32178 256 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W TKL2P33315 681 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W POP4P38336 279 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W AST2P39945 430 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YER076CP40049 302 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W LSM4P40070 187 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W FMP32P43557 207 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W ECO1P43605 281 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W OST2P46964 130 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W PEX12Q04370 399 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YPR063CQ12160 140 aa2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W RIO1Q12196 484 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RTT105YER104W MBF1O14467 151 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W DPM1P14020 267 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W SKG1P36169 355 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W NVJ1P38881 321 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W GLE2P40066 365 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data2.28□□□□□ -2.04not detected
RTT105YER104W PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W FLC3P53121 802 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W RSM10Q03201 203 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W GAS3Q03655 524 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W ECM11Q04110 302 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YLR053CQ12026 108 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W YPL162CQ12042 273 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W NSL1Q12143 216 aa2.28□□□□□ -2.04
RTT105YER104W HIS3P06633 220 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W CMD1P06787 147 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RAD10P06838 210 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SEC14P24280 304 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SEC17P32602 292 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W MID2P36027 376 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YHR125WP38831 101 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YDR249CQ03787 373 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W ATG39Q06159 398 aa2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RTT105YER104W Q0255P03881 472 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RPS24AP0CX31 135 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RPS24BP0CX32 135 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W AHC2P25649 128 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W ACP1P32463 125 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W UTP30P36144 274 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W DER1P38307 211 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W MED6P38782 295 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YIR035CP40579 254 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YFH7P43591 353 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W LSM1P47017 172 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YGL235WP53071 178 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W AIM34Q03673 198 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W PLP1Q04004 230 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SUE1Q06524 206 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YLR031WQ07978 186 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W PEX11Q12462 236 aa2.26□□□□□ -2.05
RTT105YER104W REP2P03872 296 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RPL9AP05738 191 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YLR156WP0CE96 114 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YLR159WP0CE97 114 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YLR161WP0CE98 114 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W URA5P13298 226 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RPB3P16370 318 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W BET1P22804 142 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W EDC3P39998 551 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YER188WP40103 239 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W GON7P46984 123 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W ARP3P47117 449 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RPL9BP51401 191 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YGR026WP53217 278 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SHH4Q06236 168 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W RDI1Q12434 202 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W PSF1Q12488 208 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W MHT1Q12525 324 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YPR014CQ6B0W2 109 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W SAS5Q99314 248 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W PET20Q99373 253 aa2.25□□□□□ -2.05
RTT105YER104W YIL177CP40434 1758 aa2.24□□□□□ -2.05
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