RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 AFMIDQ63HM1 303 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CYB5RLQ6IPT4 315 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ZNF627Q7L945 461 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MB21D1Q8N884 522 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 C3orf20Q8ND61 904 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 PGBD4Q96DM1 585 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CGRRF1Q99675 332 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 GABBR1Q9UBS5 961 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 POLHQ9Y253 713 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.28□□□□□ -1.4
TRDN-204ENST00000542443 SAMD9Q5K651 1589 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CUL7Q14999 1698 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PTPRKQ15262 1439 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 FAM20BO75063 409 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MYBP10242 640 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ALDH1A3P47895 512 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A3Q00325 362 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 NOGQ13253 232 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 GALEQ14376 348 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MFSD5Q6N075 450 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 TONSLQ96HA7 1378 aa6.27□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 FMN1Q68DA7 1419 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 A6NNZ2 444 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 B5MCH6 92 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PJA2O43164 708 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ARIH2O95376 493 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MALP21145 153 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 HTR1BP28222 390 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 USP14P54578 494 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 DOK3Q7L591 496 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 TIFAQ96CG3 184 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.26□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 XDHP47989 1333 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MFAP3LO75121 409 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CAND2O75155 1236 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PEX11BO96011 259 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 SNAPC2Q13487 334 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ANKS6Q68DC2 871 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC4Q8TBB5 520 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 EPC1Q9H2F5 836 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 MIA2Q96PC5 1412 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 GRIN2BQ13224 1484 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 INSRP06213 1382 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 CCDC7Q96M83 1385 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 FAM227AF5H4B4 570 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 RAMP2O60895 175 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 HRGP04196 525 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 RAP2AP10114 183 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 ATP5JP18859 108 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 RABGGTBP53611 331 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-204ENST00000542443 PURAQ00577 322 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms