RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322090.7

NIPSNAP2-201, Transcript of nipsnap homolog 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP2, Length 1,999 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PAFAH1B1P43034 410 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF132P52740 706 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CFAP221Q4G0U5 840 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIB2Q92519 343 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ADPGKQ9BRR6 497 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CDHR5Q9HBB8 845 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RAB21Q9UL25 225 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MTA2O94776 668 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NFICP08651 508 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FGFR4P22455 802 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HOXC8P31273 242 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HES6Q96HZ4 224 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 EHD2Q9NZN4 543 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GTF3C4Q9UKN8 822 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GINS2Q9Y248 185 aa24.29■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TREHO43280 583 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CLSTN1O94985 981 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DNA2P51530 1060 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 JADE1Q6IE81 842 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TAF4BQ92750 862 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MS4A14Q96JA4 679 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PNKPQ96T60 521 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SIX4Q9UIU6 781 aa24.28■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CYP1A2P05177 515 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DARSP14868 501 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GNA15P30679 374 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF699Q32M78 642 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MMGT1Q8N4V1 131 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CXorf38Q8TB03 319 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 OSMRQ99650 979 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 AMFRQ9UKV5 643 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MROH7Q68CQ1 1323 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CEP350Q5VT06 3117 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KCNK3O14649 394 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ASPAP45381 313 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GJA9P57773 515 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C2orf54Q08AI8 447 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PBKQ96KB5 322 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ACAP3Q96P50 834 aa24.27■■□□□ 1.48
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MYADML2A6NDP7 307 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TUBBP07437 444 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GRM5P41594 1212 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CISHQ9NSE2 258 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF446Q9NWS9 450 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SRRDQ9UH36 339 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C2CD2Q9Y426 696 aa24.26■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CCDC151A5D8V7 595 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HSPA6P17066 643 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CENPCQ03188 943 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PTPROQ16827 1216 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C11orf63Q6NUN7 778 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CATSPER4Q7RTX7 472 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF653Q96CK0 615 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KPNA6O60684 536 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 BRD3Q15059 726 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 SLC27A1Q6PCB7 646 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.25■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 KRT19P08727 400 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 GNAT1P11488 350 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 WDR93Q6P2C0 686 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CD302Q8IX05 232 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 C7orf31Q8N865 590 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ALG6Q9Y672 507 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HTTP42858 3142 aa24.24■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 CFHP08603 1231 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 HOXD10P28358 340 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TRIM32Q13049 653 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NOTUMQ6P988 496 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 NME8Q8N427 588 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 ACTRT1Q8TDG2 376 aa24.23■■□□□ 1.47
NIPSNAP2-201ENST00000322090 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.3 ms