RNA–Protein interactions for RNA: YPR094W

RDS3, Transcript of Component of the SF3b subcomplex of the U2 snRNP, yeastyeast

Gene RDS3, Length 324 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3YPR094W GPI12P23797 304 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W AHT1P29589 182 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SMI1P32566 505 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YBR063CP38083 404 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W END3P39013 349 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SNZ3P43545 298 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W PDR16P53860 351 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W ERP4Q12450 207 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W ODC2Q99297 307 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W HTL1Q9URQ5 78 aa-0.82□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W IPP1P00817 287 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W CDC37P06101 506 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W SEN2P16658 377 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MRPS28P21771 286 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W UBC8P28263 218 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W UMP1P38293 148 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W HSM3P38348 480 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W THO1P40040 218 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W EAF6P47128 113 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YKR005CQ02203 525 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W FSF1Q12029 327 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YPR013CQ12145 317 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YOR020W-AQ3E824 90 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W ATG40Q99325 256 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YPR117WQ06116 2489 aa-0.83□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W REP2P03872 296 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YKR104WP0CE69 306 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W DAL82P21705 255 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W CSM1P25651 190 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W RPS5P26783 225 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W MRPL40P36534 297 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YBR242WP38331 238 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W HPA3P39979 161 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W PRE6P40303 254 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YPL073CP40323 161 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W DSN1P40568 576 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W BNA7Q04066 261 aa-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W FAS1P07149 2051 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W BLM10P43583 2143 aa-0.85□□□□□ -2.54
RDS3YPR094W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPL43BP0CX26 92 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W DAL80P26343 269 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPC25P35718 212 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W MRPL17P36528 281 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RSM25P40496 264 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W NAS2P40555 220 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W DCV1P43595 202 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W LSB1P53281 241 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YNL046WP53956 172 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W MET31Q03081 177 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YLR297WQ05899 129 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W VAC14Q06708 880 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YPL229WQ99395 206 aa-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W FRS2P15625 503 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YCR001WP25347 104 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W QRI5P32344 111 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SNC2P33328 115 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPB7P34087 171 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YKL070WP36087 169 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W CAT5P41735 233 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W VOA1P53262 265 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SNZ2P53824 298 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W TMA23Q03525 211 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W FIT1Q04433 528 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SNF8Q12483 233 aa-0.86□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YPR170W-BP0C5R9 85 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SAR1P20606 190 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SPO13P23624 291 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W PET18P25362 215 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W PTC1P35182 281 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W BLI1P35727 113 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.87□□□□□ -2.55not detected
RDS3YPR094W MRPL39P36533 70 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YBR096WP38256 230 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W URA8P38627 578 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SSO2P39926 295 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YER034WP40022 185 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YJR012CP47087 207 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W HAM1P47119 197 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YNL010WP53981 241 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SPG4Q04438 115 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W RRG8Q06109 277 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W ATG17Q06410 417 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W GPM2Q12008 311 aa-0.87□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W SNF2P22082 1703 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YLR156WP0CE96 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YLR159WP0CE97 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
RDS3YPR094W YLR161WP0CE98 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
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