RNA–Protein interactions for RNA: YLL008W

DRS1, Transcript of Nucleolar DEAD-box protein required for ribosome assembly and function, yeast

Gene DRS1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DRS1	YLL008W	CCC1	P47818	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	SNO1	Q03144	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	SPS18	P32572	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YNG1	Q08465	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	IES3	Q12345	250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YOX1	P34161	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	SRP14	P38985	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	MMS2	P53152	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	JID1	Q12350	301 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	BBP1	Q12365	385 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	IZH2	Q12442	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	MET2	P08465	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	CDC50	P25656	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	BIR1	P47134	954 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	COG7	P53195	279 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	PDR17	P53844	350 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	ERV2	Q12284	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	MRX4	Q12467	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	APC1	P53886	1748 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YET3	Q07451	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	RFU1	Q08003	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	FDH1	Q08911	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YLR460C	P54007	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	PUT1	P09368	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	DRE2	P36152	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	SHG1	P38337	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	CYC2	P38909	366 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	USO1	P25386	1790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	COS2	P0CX12	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	COS3	P0CX13	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	GPA2	P10823	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	COS4	P43542	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YFH7	P43591	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YNL046W	P53956	172 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YML096W	Q04489	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	QCR2	P07257	368 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
DRS1	YLL008W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	PBA1	Q05778	276 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	FYV7	Q12247	151 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	BNI1	P41832	1953 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DRS1	YLL008W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CPT1	P17898	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ERD2	P18414	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CLG1	P35190	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	MRPL28	P36527	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	AIM2	P39721	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YFL064C	P43540	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	NRK1	P53915	240 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CRZ1	P53968	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CWC27	Q02770	301 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	COX5A	P00424	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	POP8	P38208	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	SWP1	Q02795	286 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YOR186W	Q08560	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DRS1	YLL008W	REE1	P40893	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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