RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	C16orf87	Q6PH81	154 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RBBP8	Q99708	897 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		7.26	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	HEATR9	A2RTY3	570 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	C2orf81	A6NN90	581 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	HBP1	O60381	514 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	XYLB	O75191	536 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	POMC	P01189	267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MYBL2	P10244	700 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CDC27	P30260	824 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	S100A5	P33763	92 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	EPHB3	P54753	998 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PDK1	Q15118	436 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SNX31	Q8N9S9	440 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	APPL1	Q9UKG1	709 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NDUFB5	O43674	189 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CYP2C8	P10632	490 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ATP1A2	P50993	1020 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SIK2	Q9H0K1	926 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SASH1	O94885	1247 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CPA1	P15085	419 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TYK2	P29597	1187 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NDUFA8	P51970	172 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PRKAA1	Q13131	559 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC184	Q52MB2	194 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	MSRA	Q9UJ68	235 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	FYN	P06241	537 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KRT24	Q2M2I5	525 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	C18orf8	Q96DM3	657 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25	6e-7	■■■□□ 15.8
CHD2-208	ENST00000626874	IFNAR2	P48551	515 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZSCAN26	Q16670	478 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF284	Q2VY69	593 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	USP28	Q96RU2	1077 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	STAP2	Q9UGK3	403 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	KLHL3	Q9UH77	587 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874		A0A0D9SFI3	127 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	IFNA14	P01570	189 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PRKCB	P05771	671 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SULT1E1	P49888	294 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	GNA13	Q14344	377 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCDC126	Q96EE4	140 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ADA2	Q9NZK5	511 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	SMIM22	K7EJ46	135 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	CCT8	P50990	548 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	PPIL2	Q13356	520 aa		7.24	□□□□□ -1.25
CHD2-208	ENST00000626874	ITGA9	Q13797	1035 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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